Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U0

Ifrd2, Interferon-related developmental regulator 2, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd2Q9D8U0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ifrd2Q9D8U0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ifrd2Q9D8U0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ifrd2Q9D8U0 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ifrd2Q9D8U0 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ifrd2Q9D8U0 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ifrd2Q9D8U0 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ifrd2Q9D8U0 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ifrd2Q9D8U0 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ifrd2Q9D8U0 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ifrd2Q9D8U0 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ifrd2Q9D8U0 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ifrd2Q9D8U0 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ifrd2Q9D8U0 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ifrd2Q9D8U0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ifrd2Q9D8U0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ifrd2Q9D8U0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ifrd2Q9D8U0 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ifrd2Q9D8U0 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ifrd2Q9D8U0 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ifrd2Q9D8U0 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ifrd2Q9D8U0 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ifrd2Q9D8U0 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ifrd2Q9D8U0 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ifrd2Q9D8U0 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ifrd2Q9D8U0 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ifrd2Q9D8U0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ifrd2Q9D8U0 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ifrd2Q9D8U0 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ifrd2Q9D8U0 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ifrd2Q9D8U0 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ifrd2Q9D8U0 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ifrd2Q9D8U0 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ifrd2Q9D8U0 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ifrd2Q9D8U0 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ifrd2Q9D8U0 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ifrd2Q9D8U0 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ifrd2Q9D8U0 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ifrd2Q9D8U0 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ifrd2Q9D8U0 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ifrd2Q9D8U0 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ifrd2Q9D8U0 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ifrd2Q9D8U0 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ifrd2Q9D8U0 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ifrd2Q9D8U0 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ifrd2Q9D8U0 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ifrd2Q9D8U0 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ifrd2Q9D8U0 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ifrd2Q9D8U0 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ifrd2Q9D8U0 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ifrd2Q9D8U0 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ifrd2Q9D8U0 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ifrd2Q9D8U0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ifrd2Q9D8U0 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ifrd2Q9D8U0 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ifrd2Q9D8U0 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ifrd2Q9D8U0 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ifrd2Q9D8U0 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ifrd2Q9D8U0 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ifrd2Q9D8U0 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ifrd2Q9D8U0 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ifrd2Q9D8U0 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ifrd2Q9D8U0 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ifrd2Q9D8U0 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ifrd2Q9D8U0 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ifrd2Q9D8U0 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ifrd2Q9D8U0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ifrd2Q9D8U0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ifrd2Q9D8U0 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ifrd2Q9D8U0 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ifrd2Q9D8U0 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ifrd2Q9D8U0 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ifrd2Q9D8U0 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ifrd2Q9D8U0 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifrd2Q9D8U0 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifrd2Q9D8U0 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifrd2Q9D8U0 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifrd2Q9D8U0 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifrd2Q9D8U0 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifrd2Q9D8U0 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifrd2Q9D8U0 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifrd2Q9D8U0 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifrd2Q9D8U0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifrd2Q9D8U0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifrd2Q9D8U0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifrd2Q9D8U0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifrd2Q9D8U0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifrd2Q9D8U0 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifrd2Q9D8U0 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifrd2Q9D8U0 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifrd2Q9D8U0 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifrd2Q9D8U0 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifrd2Q9D8U0 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifrd2Q9D8U0 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ifrd2Q9D8U0 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ifrd2Q9D8U0 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ifrd2Q9D8U0 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ifrd2Q9D8U0 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ifrd2Q9D8U0 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ifrd2Q9D8U0 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms