Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T7

Slirp, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlirpQ9D8T7 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SlirpQ9D8T7 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SlirpQ9D8T7 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SlirpQ9D8T7 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SlirpQ9D8T7 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SlirpQ9D8T7 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SlirpQ9D8T7 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SlirpQ9D8T7 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SlirpQ9D8T7 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SlirpQ9D8T7 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SlirpQ9D8T7 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SlirpQ9D8T7 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SlirpQ9D8T7 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SlirpQ9D8T7 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SlirpQ9D8T7 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SlirpQ9D8T7 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SlirpQ9D8T7 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SlirpQ9D8T7 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SlirpQ9D8T7 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SlirpQ9D8T7 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SlirpQ9D8T7 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SlirpQ9D8T7 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SlirpQ9D8T7 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SlirpQ9D8T7 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SlirpQ9D8T7 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SlirpQ9D8T7 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SlirpQ9D8T7 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SlirpQ9D8T7 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SlirpQ9D8T7 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SlirpQ9D8T7 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SlirpQ9D8T7 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SlirpQ9D8T7 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SlirpQ9D8T7 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SlirpQ9D8T7 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SlirpQ9D8T7 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SlirpQ9D8T7 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SlirpQ9D8T7 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SlirpQ9D8T7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SlirpQ9D8T7 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SlirpQ9D8T7 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SlirpQ9D8T7 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SlirpQ9D8T7 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SlirpQ9D8T7 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SlirpQ9D8T7 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SlirpQ9D8T7 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SlirpQ9D8T7 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SlirpQ9D8T7 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SlirpQ9D8T7 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SlirpQ9D8T7 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SlirpQ9D8T7 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SlirpQ9D8T7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
SlirpQ9D8T7 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SlirpQ9D8T7 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SlirpQ9D8T7 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SlirpQ9D8T7 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SlirpQ9D8T7 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SlirpQ9D8T7 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SlirpQ9D8T7 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SlirpQ9D8T7 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SlirpQ9D8T7 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SlirpQ9D8T7 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SlirpQ9D8T7 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SlirpQ9D8T7 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SlirpQ9D8T7 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SlirpQ9D8T7 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SlirpQ9D8T7 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SlirpQ9D8T7 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SlirpQ9D8T7 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SlirpQ9D8T7 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SlirpQ9D8T7 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SlirpQ9D8T7 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SlirpQ9D8T7 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SlirpQ9D8T7 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SlirpQ9D8T7 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SlirpQ9D8T7 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SlirpQ9D8T7 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SlirpQ9D8T7 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SlirpQ9D8T7 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SlirpQ9D8T7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SlirpQ9D8T7 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SlirpQ9D8T7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SlirpQ9D8T7 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SlirpQ9D8T7 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SlirpQ9D8T7 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SlirpQ9D8T7 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SlirpQ9D8T7 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SlirpQ9D8T7 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SlirpQ9D8T7 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SlirpQ9D8T7 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SlirpQ9D8T7 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SlirpQ9D8T7 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SlirpQ9D8T7 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SlirpQ9D8T7 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SlirpQ9D8T7 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SlirpQ9D8T7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SlirpQ9D8T7 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SlirpQ9D8T7 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SlirpQ9D8T7 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SlirpQ9D8T7 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SlirpQ9D8T7 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.9 ms