Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rpl4Q9D8E6 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Rpl4Q9D8E6 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rpl4Q9D8E6 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rpl4Q9D8E6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rpl4Q9D8E6 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rpl4Q9D8E6 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rpl4Q9D8E6 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rpl4Q9D8E6 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rpl4Q9D8E6 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rpl4Q9D8E6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rpl4Q9D8E6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rpl4Q9D8E6 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rpl4Q9D8E6 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Rpl4Q9D8E6 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rpl4Q9D8E6 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rpl4Q9D8E6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rpl4Q9D8E6 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Rpl4Q9D8E6 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rpl4Q9D8E6 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rpl4Q9D8E6 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rpl4Q9D8E6 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rpl4Q9D8E6 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rpl4Q9D8E6 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rpl4Q9D8E6 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rpl4Q9D8E6 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rpl4Q9D8E6 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rpl4Q9D8E6 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rpl4Q9D8E6 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Rpl4Q9D8E6 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rpl4Q9D8E6 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rpl4Q9D8E6 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rpl4Q9D8E6 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rpl4Q9D8E6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rpl4Q9D8E6 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rpl4Q9D8E6 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rpl4Q9D8E6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rpl4Q9D8E6 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rpl4Q9D8E6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rpl4Q9D8E6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rpl4Q9D8E6 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rpl4Q9D8E6 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rpl4Q9D8E6 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rpl4Q9D8E6 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rpl4Q9D8E6 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rpl4Q9D8E6 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rpl4Q9D8E6 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rpl4Q9D8E6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rpl4Q9D8E6 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rpl4Q9D8E6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rpl4Q9D8E6 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rpl4Q9D8E6 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rpl4Q9D8E6 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Rpl4Q9D8E6 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rpl4Q9D8E6 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rpl4Q9D8E6 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rpl4Q9D8E6 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rpl4Q9D8E6 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rpl4Q9D8E6 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rpl4Q9D8E6 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rpl4Q9D8E6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rpl4Q9D8E6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rpl4Q9D8E6 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rpl4Q9D8E6 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rpl4Q9D8E6 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rpl4Q9D8E6 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rpl4Q9D8E6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rpl4Q9D8E6 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rpl4Q9D8E6 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rpl4Q9D8E6 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rpl4Q9D8E6 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rpl4Q9D8E6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rpl4Q9D8E6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rpl4Q9D8E6 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rpl4Q9D8E6 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rpl4Q9D8E6 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rpl4Q9D8E6 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rpl4Q9D8E6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rpl4Q9D8E6 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Rpl4Q9D8E6 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rpl4Q9D8E6 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Rpl4Q9D8E6 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rpl4Q9D8E6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rpl4Q9D8E6 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rpl4Q9D8E6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rpl4Q9D8E6 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rpl4Q9D8E6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rpl4Q9D8E6 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rpl4Q9D8E6 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rpl4Q9D8E6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rpl4Q9D8E6 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rpl4Q9D8E6 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rpl4Q9D8E6 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rpl4Q9D8E6 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rpl4Q9D8E6 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rpl4Q9D8E6 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rpl4Q9D8E6 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rpl4Q9D8E6 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rpl4Q9D8E6 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rpl4Q9D8E6 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms