Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F7

Chmp4c, Charged multivesicular body protein 4c, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4cQ9D7F7 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chmp4cQ9D7F7 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chmp4cQ9D7F7 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chmp4cQ9D7F7 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Chmp4cQ9D7F7 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chmp4cQ9D7F7 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chmp4cQ9D7F7 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chmp4cQ9D7F7 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chmp4cQ9D7F7 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chmp4cQ9D7F7 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chmp4cQ9D7F7 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chmp4cQ9D7F7 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chmp4cQ9D7F7 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chmp4cQ9D7F7 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chmp4cQ9D7F7 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chmp4cQ9D7F7 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chmp4cQ9D7F7 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chmp4cQ9D7F7 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chmp4cQ9D7F7 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chmp4cQ9D7F7 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Chmp4cQ9D7F7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chmp4cQ9D7F7 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chmp4cQ9D7F7 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chmp4cQ9D7F7 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chmp4cQ9D7F7 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chmp4cQ9D7F7 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chmp4cQ9D7F7 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chmp4cQ9D7F7 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chmp4cQ9D7F7 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chmp4cQ9D7F7 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chmp4cQ9D7F7 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chmp4cQ9D7F7 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chmp4cQ9D7F7 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chmp4cQ9D7F7 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chmp4cQ9D7F7 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chmp4cQ9D7F7 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chmp4cQ9D7F7 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chmp4cQ9D7F7 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chmp4cQ9D7F7 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chmp4cQ9D7F7 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chmp4cQ9D7F7 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chmp4cQ9D7F7 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chmp4cQ9D7F7 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chmp4cQ9D7F7 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Chmp4cQ9D7F7 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chmp4cQ9D7F7 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chmp4cQ9D7F7 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chmp4cQ9D7F7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chmp4cQ9D7F7 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chmp4cQ9D7F7 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chmp4cQ9D7F7 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chmp4cQ9D7F7 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chmp4cQ9D7F7 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Chmp4cQ9D7F7 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chmp4cQ9D7F7 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chmp4cQ9D7F7 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chmp4cQ9D7F7 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Chmp4cQ9D7F7 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chmp4cQ9D7F7 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chmp4cQ9D7F7 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chmp4cQ9D7F7 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chmp4cQ9D7F7 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chmp4cQ9D7F7 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chmp4cQ9D7F7 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chmp4cQ9D7F7 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chmp4cQ9D7F7 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chmp4cQ9D7F7 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chmp4cQ9D7F7 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chmp4cQ9D7F7 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chmp4cQ9D7F7 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chmp4cQ9D7F7 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chmp4cQ9D7F7 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chmp4cQ9D7F7 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chmp4cQ9D7F7 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chmp4cQ9D7F7 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chmp4cQ9D7F7 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chmp4cQ9D7F7 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chmp4cQ9D7F7 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chmp4cQ9D7F7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chmp4cQ9D7F7 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chmp4cQ9D7F7 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chmp4cQ9D7F7 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chmp4cQ9D7F7 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chmp4cQ9D7F7 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chmp4cQ9D7F7 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chmp4cQ9D7F7 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chmp4cQ9D7F7 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chmp4cQ9D7F7 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chmp4cQ9D7F7 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chmp4cQ9D7F7 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chmp4cQ9D7F7 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chmp4cQ9D7F7 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chmp4cQ9D7F7 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chmp4cQ9D7F7 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chmp4cQ9D7F7 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chmp4cQ9D7F7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chmp4cQ9D7F7 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chmp4cQ9D7F7 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chmp4cQ9D7F7 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chmp4cQ9D7F7 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms