Protein–RNA interactions for Protein: Q9D658

Ptp4a3, Protein tyrosine phosphatase type IVA 3, mousemouse

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptp4a3Q9D658 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptp4a3Q9D658 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptp4a3Q9D658 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptp4a3Q9D658 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptp4a3Q9D658 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptp4a3Q9D658 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptp4a3Q9D658 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptp4a3Q9D658 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptp4a3Q9D658 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptp4a3Q9D658 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptp4a3Q9D658 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptp4a3Q9D658 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptp4a3Q9D658 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptp4a3Q9D658 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptp4a3Q9D658 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptp4a3Q9D658 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptp4a3Q9D658 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptp4a3Q9D658 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptp4a3Q9D658 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptp4a3Q9D658 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptp4a3Q9D658 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptp4a3Q9D658 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptp4a3Q9D658 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptp4a3Q9D658 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptp4a3Q9D658 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptp4a3Q9D658 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptp4a3Q9D658 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptp4a3Q9D658 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptp4a3Q9D658 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptp4a3Q9D658 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptp4a3Q9D658 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptp4a3Q9D658 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptp4a3Q9D658 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptp4a3Q9D658 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptp4a3Q9D658 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptp4a3Q9D658 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptp4a3Q9D658 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptp4a3Q9D658 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptp4a3Q9D658 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptp4a3Q9D658 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptp4a3Q9D658 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptp4a3Q9D658 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptp4a3Q9D658 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptp4a3Q9D658 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptp4a3Q9D658 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptp4a3Q9D658 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptp4a3Q9D658 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptp4a3Q9D658 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptp4a3Q9D658 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptp4a3Q9D658 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptp4a3Q9D658 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptp4a3Q9D658 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptp4a3Q9D658 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptp4a3Q9D658 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptp4a3Q9D658 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptp4a3Q9D658 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptp4a3Q9D658 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptp4a3Q9D658 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Ptp4a3Q9D658 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ptp4a3Q9D658 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ptp4a3Q9D658 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ptp4a3Q9D658 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
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Ptp4a3Q9D658 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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Ptp4a3Q9D658 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptp4a3Q9D658 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptp4a3Q9D658 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptp4a3Q9D658 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptp4a3Q9D658 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptp4a3Q9D658 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptp4a3Q9D658 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptp4a3Q9D658 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptp4a3Q9D658 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptp4a3Q9D658 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptp4a3Q9D658 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptp4a3Q9D658 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptp4a3Q9D658 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptp4a3Q9D658 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptp4a3Q9D658 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptp4a3Q9D658 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptp4a3Q9D658 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptp4a3Q9D658 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptp4a3Q9D658 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptp4a3Q9D658 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptp4a3Q9D658 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptp4a3Q9D658 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptp4a3Q9D658 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptp4a3Q9D658 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptp4a3Q9D658 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptp4a3Q9D658 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptp4a3Q9D658 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptp4a3Q9D658 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptp4a3Q9D658 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptp4a3Q9D658 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptp4a3Q9D658 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptp4a3Q9D658 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptp4a3Q9D658 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptp4a3Q9D658 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms