Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrameQ9D4Z5 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrameQ9D4Z5 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrameQ9D4Z5 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrameQ9D4Z5 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrameQ9D4Z5 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrameQ9D4Z5 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrameQ9D4Z5 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrameQ9D4Z5 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrameQ9D4Z5 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrameQ9D4Z5 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrameQ9D4Z5 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PrameQ9D4Z5 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PrameQ9D4Z5 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PrameQ9D4Z5 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PrameQ9D4Z5 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PrameQ9D4Z5 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PrameQ9D4Z5 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PrameQ9D4Z5 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PrameQ9D4Z5 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PrameQ9D4Z5 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PrameQ9D4Z5 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PrameQ9D4Z5 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PrameQ9D4Z5 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PrameQ9D4Z5 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PrameQ9D4Z5 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PrameQ9D4Z5 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PrameQ9D4Z5 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PrameQ9D4Z5 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PrameQ9D4Z5 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PrameQ9D4Z5 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PrameQ9D4Z5 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PrameQ9D4Z5 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PrameQ9D4Z5 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PrameQ9D4Z5 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PrameQ9D4Z5 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PrameQ9D4Z5 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PrameQ9D4Z5 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PrameQ9D4Z5 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PrameQ9D4Z5 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PrameQ9D4Z5 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PrameQ9D4Z5 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PrameQ9D4Z5 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PrameQ9D4Z5 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PrameQ9D4Z5 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PrameQ9D4Z5 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PrameQ9D4Z5 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PrameQ9D4Z5 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PrameQ9D4Z5 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PrameQ9D4Z5 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PrameQ9D4Z5 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PrameQ9D4Z5 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PrameQ9D4Z5 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PrameQ9D4Z5 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PrameQ9D4Z5 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PrameQ9D4Z5 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PrameQ9D4Z5 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PrameQ9D4Z5 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrameQ9D4Z5 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrameQ9D4Z5 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrameQ9D4Z5 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PrameQ9D4Z5 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrameQ9D4Z5 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrameQ9D4Z5 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrameQ9D4Z5 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrameQ9D4Z5 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrameQ9D4Z5 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrameQ9D4Z5 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrameQ9D4Z5 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrameQ9D4Z5 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrameQ9D4Z5 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrameQ9D4Z5 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrameQ9D4Z5 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrameQ9D4Z5 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PrameQ9D4Z5 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrameQ9D4Z5 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrameQ9D4Z5 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrameQ9D4Z5 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrameQ9D4Z5 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrameQ9D4Z5 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrameQ9D4Z5 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrameQ9D4Z5 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrameQ9D4Z5 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrameQ9D4Z5 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrameQ9D4Z5 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrameQ9D4Z5 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PrameQ9D4Z5 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrameQ9D4Z5 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrameQ9D4Z5 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrameQ9D4Z5 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrameQ9D4Z5 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrameQ9D4Z5 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PrameQ9D4Z5 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PrameQ9D4Z5 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrameQ9D4Z5 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrameQ9D4Z5 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrameQ9D4Z5 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrameQ9D4Z5 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrameQ9D4Z5 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrameQ9D4Z5 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms