Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Q4

4930578G10Rik, RIKEN cDNA 4930578G10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
4930578G10RikQ9D4Q4 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
4930578G10RikQ9D4Q4 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
4930578G10RikQ9D4Q4 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
4930578G10RikQ9D4Q4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
4930578G10RikQ9D4Q4 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
4930578G10RikQ9D4Q4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
4930578G10RikQ9D4Q4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
4930578G10RikQ9D4Q4 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
4930578G10RikQ9D4Q4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
4930578G10RikQ9D4Q4 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
4930578G10RikQ9D4Q4 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
4930578G10RikQ9D4Q4 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
4930578G10RikQ9D4Q4 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
4930578G10RikQ9D4Q4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
4930578G10RikQ9D4Q4 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
4930578G10RikQ9D4Q4 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
4930578G10RikQ9D4Q4 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
4930578G10RikQ9D4Q4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
4930578G10RikQ9D4Q4 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
4930578G10RikQ9D4Q4 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
4930578G10RikQ9D4Q4 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
4930578G10RikQ9D4Q4 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
4930578G10RikQ9D4Q4 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
4930578G10RikQ9D4Q4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
4930578G10RikQ9D4Q4 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
4930578G10RikQ9D4Q4 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
4930578G10RikQ9D4Q4 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
4930578G10RikQ9D4Q4 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
4930578G10RikQ9D4Q4 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
4930578G10RikQ9D4Q4 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
4930578G10RikQ9D4Q4 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
4930578G10RikQ9D4Q4 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
4930578G10RikQ9D4Q4 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
4930578G10RikQ9D4Q4 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
4930578G10RikQ9D4Q4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
4930578G10RikQ9D4Q4 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
4930578G10RikQ9D4Q4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
4930578G10RikQ9D4Q4 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
4930578G10RikQ9D4Q4 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
4930578G10RikQ9D4Q4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
4930578G10RikQ9D4Q4 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
4930578G10RikQ9D4Q4 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
4930578G10RikQ9D4Q4 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
4930578G10RikQ9D4Q4 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
4930578G10RikQ9D4Q4 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
4930578G10RikQ9D4Q4 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
4930578G10RikQ9D4Q4 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
4930578G10RikQ9D4Q4 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
4930578G10RikQ9D4Q4 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
4930578G10RikQ9D4Q4 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
4930578G10RikQ9D4Q4 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
4930578G10RikQ9D4Q4 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
4930578G10RikQ9D4Q4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
4930578G10RikQ9D4Q4 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
4930578G10RikQ9D4Q4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
4930578G10RikQ9D4Q4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
4930578G10RikQ9D4Q4 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
4930578G10RikQ9D4Q4 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
4930578G10RikQ9D4Q4 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
4930578G10RikQ9D4Q4 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
4930578G10RikQ9D4Q4 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
4930578G10RikQ9D4Q4 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
4930578G10RikQ9D4Q4 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
4930578G10RikQ9D4Q4 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
4930578G10RikQ9D4Q4 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
4930578G10RikQ9D4Q4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
4930578G10RikQ9D4Q4 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
4930578G10RikQ9D4Q4 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
4930578G10RikQ9D4Q4 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
4930578G10RikQ9D4Q4 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
4930578G10RikQ9D4Q4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
4930578G10RikQ9D4Q4 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
4930578G10RikQ9D4Q4 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
4930578G10RikQ9D4Q4 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
4930578G10RikQ9D4Q4 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
4930578G10RikQ9D4Q4 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
4930578G10RikQ9D4Q4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
4930578G10RikQ9D4Q4 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
4930578G10RikQ9D4Q4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
4930578G10RikQ9D4Q4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
4930578G10RikQ9D4Q4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
4930578G10RikQ9D4Q4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
4930578G10RikQ9D4Q4 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
4930578G10RikQ9D4Q4 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
4930578G10RikQ9D4Q4 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
4930578G10RikQ9D4Q4 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
4930578G10RikQ9D4Q4 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
4930578G10RikQ9D4Q4 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
4930578G10RikQ9D4Q4 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
4930578G10RikQ9D4Q4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
4930578G10RikQ9D4Q4 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms