Protein–RNA interactions for Protein: Q9D454

Uncharacterized protein CXorf49 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D454 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q9D454 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q9D454 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q9D454 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q9D454 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q9D454 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q9D454 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q9D454 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q9D454 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q9D454 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Q9D454 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q9D454 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q9D454 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Q9D454 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q9D454 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q9D454 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q9D454 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q9D454 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q9D454 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q9D454 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q9D454 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Q9D454 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q9D454 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q9D454 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Q9D454 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q9D454 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q9D454 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q9D454 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Q9D454 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q9D454 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q9D454 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q9D454 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q9D454 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q9D454 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q9D454 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q9D454 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q9D454 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q9D454 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q9D454 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q9D454 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q9D454 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q9D454 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q9D454 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q9D454 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q9D454 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q9D454 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q9D454 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q9D454 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q9D454 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q9D454 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q9D454 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q9D454 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q9D454 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Q9D454 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q9D454 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q9D454 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q9D454 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q9D454 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q9D454 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q9D454 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q9D454 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q9D454 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q9D454 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q9D454 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q9D454 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q9D454 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q9D454 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q9D454 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q9D454 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q9D454 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q9D454 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q9D454 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q9D454 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q9D454 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q9D454 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q9D454 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q9D454 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q9D454 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q9D454 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q9D454 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q9D454 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q9D454 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q9D454 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q9D454 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q9D454 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Q9D454 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q9D454 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q9D454 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Q9D454 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q9D454 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q9D454 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q9D454 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q9D454 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q9D454 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q9D454 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q9D454 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q9D454 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q9D454 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q9D454 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q9D454 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms