Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Syf2Q9D198 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Syf2Q9D198 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Syf2Q9D198 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Syf2Q9D198 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Syf2Q9D198 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Syf2Q9D198 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Syf2Q9D198 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Syf2Q9D198 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Syf2Q9D198 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Syf2Q9D198 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Syf2Q9D198 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Syf2Q9D198 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Syf2Q9D198 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Syf2Q9D198 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Syf2Q9D198 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Syf2Q9D198 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Syf2Q9D198 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Syf2Q9D198 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Syf2Q9D198 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Syf2Q9D198 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Syf2Q9D198 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Syf2Q9D198 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Syf2Q9D198 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Syf2Q9D198 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Syf2Q9D198 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Syf2Q9D198 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Syf2Q9D198 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Syf2Q9D198 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Syf2Q9D198 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Syf2Q9D198 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Syf2Q9D198 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Syf2Q9D198 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Syf2Q9D198 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Syf2Q9D198 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Syf2Q9D198 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Syf2Q9D198 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Syf2Q9D198 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Syf2Q9D198 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Syf2Q9D198 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Syf2Q9D198 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Syf2Q9D198 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Syf2Q9D198 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Syf2Q9D198 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Syf2Q9D198 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Syf2Q9D198 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Syf2Q9D198 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Syf2Q9D198 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Syf2Q9D198 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Syf2Q9D198 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Syf2Q9D198 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Syf2Q9D198 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Syf2Q9D198 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Syf2Q9D198 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Syf2Q9D198 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Syf2Q9D198 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Syf2Q9D198 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Syf2Q9D198 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Syf2Q9D198 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Syf2Q9D198 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Syf2Q9D198 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Syf2Q9D198 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Syf2Q9D198 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Syf2Q9D198 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Syf2Q9D198 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Syf2Q9D198 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Syf2Q9D198 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Syf2Q9D198 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Syf2Q9D198 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Syf2Q9D198 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Syf2Q9D198 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Syf2Q9D198 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Syf2Q9D198 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Syf2Q9D198 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Syf2Q9D198 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Syf2Q9D198 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Syf2Q9D198 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Syf2Q9D198 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Syf2Q9D198 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Syf2Q9D198 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Syf2Q9D198 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Syf2Q9D198 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Syf2Q9D198 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Syf2Q9D198 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Syf2Q9D198 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Syf2Q9D198 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Syf2Q9D198 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Syf2Q9D198 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Syf2Q9D198 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Syf2Q9D198 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Syf2Q9D198 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Syf2Q9D198 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Syf2Q9D198 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Syf2Q9D198 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Syf2Q9D198 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Syf2Q9D198 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Syf2Q9D198 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Syf2Q9D198 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Syf2Q9D198 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Syf2Q9D198 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms