Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tmem53Q9D0Z3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tmem53Q9D0Z3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tmem53Q9D0Z3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Tmem53Q9D0Z3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tmem53Q9D0Z3 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tmem53Q9D0Z3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tmem53Q9D0Z3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmem53Q9D0Z3 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmem53Q9D0Z3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmem53Q9D0Z3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmem53Q9D0Z3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmem53Q9D0Z3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmem53Q9D0Z3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmem53Q9D0Z3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmem53Q9D0Z3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmem53Q9D0Z3 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem53Q9D0Z3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem53Q9D0Z3 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem53Q9D0Z3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem53Q9D0Z3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem53Q9D0Z3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem53Q9D0Z3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem53Q9D0Z3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem53Q9D0Z3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem53Q9D0Z3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem53Q9D0Z3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem53Q9D0Z3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem53Q9D0Z3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem53Q9D0Z3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem53Q9D0Z3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem53Q9D0Z3 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem53Q9D0Z3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem53Q9D0Z3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem53Q9D0Z3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem53Q9D0Z3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem53Q9D0Z3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem53Q9D0Z3 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem53Q9D0Z3 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem53Q9D0Z3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem53Q9D0Z3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem53Q9D0Z3 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem53Q9D0Z3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem53Q9D0Z3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem53Q9D0Z3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem53Q9D0Z3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem53Q9D0Z3 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem53Q9D0Z3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem53Q9D0Z3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem53Q9D0Z3 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem53Q9D0Z3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem53Q9D0Z3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem53Q9D0Z3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem53Q9D0Z3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem53Q9D0Z3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem53Q9D0Z3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem53Q9D0Z3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem53Q9D0Z3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem53Q9D0Z3 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem53Q9D0Z3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem53Q9D0Z3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem53Q9D0Z3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem53Q9D0Z3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem53Q9D0Z3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem53Q9D0Z3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem53Q9D0Z3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem53Q9D0Z3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem53Q9D0Z3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem53Q9D0Z3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem53Q9D0Z3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem53Q9D0Z3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem53Q9D0Z3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem53Q9D0Z3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem53Q9D0Z3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem53Q9D0Z3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem53Q9D0Z3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem53Q9D0Z3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem53Q9D0Z3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem53Q9D0Z3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem53Q9D0Z3 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem53Q9D0Z3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem53Q9D0Z3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem53Q9D0Z3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem53Q9D0Z3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem53Q9D0Z3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem53Q9D0Z3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem53Q9D0Z3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem53Q9D0Z3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem53Q9D0Z3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem53Q9D0Z3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem53Q9D0Z3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem53Q9D0Z3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem53Q9D0Z3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem53Q9D0Z3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem53Q9D0Z3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem53Q9D0Z3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmem53Q9D0Z3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmem53Q9D0Z3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmem53Q9D0Z3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmem53Q9D0Z3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms