Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Zbed3Q9D0L1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Zbed3Q9D0L1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zbed3Q9D0L1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zbed3Q9D0L1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zbed3Q9D0L1 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Zbed3Q9D0L1 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Zbed3Q9D0L1 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zbed3Q9D0L1 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zbed3Q9D0L1 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Zbed3Q9D0L1 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zbed3Q9D0L1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zbed3Q9D0L1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zbed3Q9D0L1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zbed3Q9D0L1 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Zbed3Q9D0L1 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zbed3Q9D0L1 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zbed3Q9D0L1 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zbed3Q9D0L1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zbed3Q9D0L1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zbed3Q9D0L1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zbed3Q9D0L1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zbed3Q9D0L1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zbed3Q9D0L1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zbed3Q9D0L1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zbed3Q9D0L1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zbed3Q9D0L1 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zbed3Q9D0L1 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zbed3Q9D0L1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zbed3Q9D0L1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zbed3Q9D0L1 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zbed3Q9D0L1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zbed3Q9D0L1 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zbed3Q9D0L1 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Zbed3Q9D0L1 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Zbed3Q9D0L1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zbed3Q9D0L1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zbed3Q9D0L1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zbed3Q9D0L1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zbed3Q9D0L1 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zbed3Q9D0L1 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zbed3Q9D0L1 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zbed3Q9D0L1 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zbed3Q9D0L1 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zbed3Q9D0L1 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zbed3Q9D0L1 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zbed3Q9D0L1 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zbed3Q9D0L1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zbed3Q9D0L1 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Zbed3Q9D0L1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zbed3Q9D0L1 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zbed3Q9D0L1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zbed3Q9D0L1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zbed3Q9D0L1 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zbed3Q9D0L1 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zbed3Q9D0L1 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zbed3Q9D0L1 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zbed3Q9D0L1 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zbed3Q9D0L1 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zbed3Q9D0L1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zbed3Q9D0L1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zbed3Q9D0L1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zbed3Q9D0L1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zbed3Q9D0L1 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zbed3Q9D0L1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zbed3Q9D0L1 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Zbed3Q9D0L1 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Zbed3Q9D0L1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Zbed3Q9D0L1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Zbed3Q9D0L1 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Zbed3Q9D0L1 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zbed3Q9D0L1 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Zbed3Q9D0L1 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Zbed3Q9D0L1 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zbed3Q9D0L1 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zbed3Q9D0L1 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zbed3Q9D0L1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zbed3Q9D0L1 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zbed3Q9D0L1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zbed3Q9D0L1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zbed3Q9D0L1 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zbed3Q9D0L1 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zbed3Q9D0L1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zbed3Q9D0L1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zbed3Q9D0L1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zbed3Q9D0L1 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zbed3Q9D0L1 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Zbed3Q9D0L1 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zbed3Q9D0L1 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Zbed3Q9D0L1 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Zbed3Q9D0L1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zbed3Q9D0L1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zbed3Q9D0L1 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zbed3Q9D0L1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zbed3Q9D0L1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zbed3Q9D0L1 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zbed3Q9D0L1 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zbed3Q9D0L1 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zbed3Q9D0L1 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Zbed3Q9D0L1 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
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