Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ49

Klhl35, Kelch-like protein 35, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl35Q9CZ49 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Klhl35Q9CZ49 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Klhl35Q9CZ49 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Klhl35Q9CZ49 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Klhl35Q9CZ49 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Klhl35Q9CZ49 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Klhl35Q9CZ49 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Klhl35Q9CZ49 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Klhl35Q9CZ49 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Klhl35Q9CZ49 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Klhl35Q9CZ49 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Klhl35Q9CZ49 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Klhl35Q9CZ49 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Klhl35Q9CZ49 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Klhl35Q9CZ49 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Klhl35Q9CZ49 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Klhl35Q9CZ49 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Klhl35Q9CZ49 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Klhl35Q9CZ49 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Klhl35Q9CZ49 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Klhl35Q9CZ49 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Klhl35Q9CZ49 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Klhl35Q9CZ49 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Klhl35Q9CZ49 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Klhl35Q9CZ49 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Klhl35Q9CZ49 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Klhl35Q9CZ49 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Klhl35Q9CZ49 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Klhl35Q9CZ49 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Klhl35Q9CZ49 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Klhl35Q9CZ49 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Klhl35Q9CZ49 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Klhl35Q9CZ49 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Klhl35Q9CZ49 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Klhl35Q9CZ49 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Klhl35Q9CZ49 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Klhl35Q9CZ49 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Klhl35Q9CZ49 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Klhl35Q9CZ49 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Klhl35Q9CZ49 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Klhl35Q9CZ49 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Klhl35Q9CZ49 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Klhl35Q9CZ49 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Klhl35Q9CZ49 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Klhl35Q9CZ49 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Klhl35Q9CZ49 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Klhl35Q9CZ49 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Klhl35Q9CZ49 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Klhl35Q9CZ49 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Klhl35Q9CZ49 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Klhl35Q9CZ49 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Klhl35Q9CZ49 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Klhl35Q9CZ49 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Klhl35Q9CZ49 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Klhl35Q9CZ49 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Klhl35Q9CZ49 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Klhl35Q9CZ49 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Klhl35Q9CZ49 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Klhl35Q9CZ49 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Klhl35Q9CZ49 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Klhl35Q9CZ49 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Klhl35Q9CZ49 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Klhl35Q9CZ49 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Klhl35Q9CZ49 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Klhl35Q9CZ49 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Klhl35Q9CZ49 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Klhl35Q9CZ49 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Klhl35Q9CZ49 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Klhl35Q9CZ49 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Klhl35Q9CZ49 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Klhl35Q9CZ49 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Klhl35Q9CZ49 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Klhl35Q9CZ49 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Klhl35Q9CZ49 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Klhl35Q9CZ49 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Klhl35Q9CZ49 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Klhl35Q9CZ49 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Klhl35Q9CZ49 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Klhl35Q9CZ49 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Klhl35Q9CZ49 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Klhl35Q9CZ49 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Klhl35Q9CZ49 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Klhl35Q9CZ49 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Klhl35Q9CZ49 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Klhl35Q9CZ49 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Klhl35Q9CZ49 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Klhl35Q9CZ49 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Klhl35Q9CZ49 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Klhl35Q9CZ49 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Klhl35Q9CZ49 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Klhl35Q9CZ49 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Klhl35Q9CZ49 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Klhl35Q9CZ49 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Klhl35Q9CZ49 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Klhl35Q9CZ49 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Klhl35Q9CZ49 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Klhl35Q9CZ49 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Klhl35Q9CZ49 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Klhl35Q9CZ49 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Klhl35Q9CZ49 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms