Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXK8

Nip7, 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nip7Q9CXK8 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nip7Q9CXK8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nip7Q9CXK8 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Nip7Q9CXK8 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nip7Q9CXK8 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nip7Q9CXK8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nip7Q9CXK8 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Nip7Q9CXK8 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nip7Q9CXK8 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nip7Q9CXK8 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nip7Q9CXK8 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Nip7Q9CXK8 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nip7Q9CXK8 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nip7Q9CXK8 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Nip7Q9CXK8 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nip7Q9CXK8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nip7Q9CXK8 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nip7Q9CXK8 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nip7Q9CXK8 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Nip7Q9CXK8 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Nip7Q9CXK8 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nip7Q9CXK8 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nip7Q9CXK8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nip7Q9CXK8 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nip7Q9CXK8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nip7Q9CXK8 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nip7Q9CXK8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nip7Q9CXK8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nip7Q9CXK8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nip7Q9CXK8 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nip7Q9CXK8 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nip7Q9CXK8 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nip7Q9CXK8 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nip7Q9CXK8 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nip7Q9CXK8 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nip7Q9CXK8 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nip7Q9CXK8 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nip7Q9CXK8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nip7Q9CXK8 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nip7Q9CXK8 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nip7Q9CXK8 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nip7Q9CXK8 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Nip7Q9CXK8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nip7Q9CXK8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nip7Q9CXK8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nip7Q9CXK8 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nip7Q9CXK8 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Nip7Q9CXK8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nip7Q9CXK8 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Nip7Q9CXK8 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nip7Q9CXK8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nip7Q9CXK8 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nip7Q9CXK8 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nip7Q9CXK8 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nip7Q9CXK8 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nip7Q9CXK8 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nip7Q9CXK8 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nip7Q9CXK8 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nip7Q9CXK8 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Nip7Q9CXK8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Nip7Q9CXK8 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nip7Q9CXK8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nip7Q9CXK8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nip7Q9CXK8 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nip7Q9CXK8 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nip7Q9CXK8 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nip7Q9CXK8 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nip7Q9CXK8 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nip7Q9CXK8 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nip7Q9CXK8 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nip7Q9CXK8 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nip7Q9CXK8 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nip7Q9CXK8 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nip7Q9CXK8 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nip7Q9CXK8 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nip7Q9CXK8 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nip7Q9CXK8 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nip7Q9CXK8 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nip7Q9CXK8 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nip7Q9CXK8 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Nip7Q9CXK8 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nip7Q9CXK8 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nip7Q9CXK8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nip7Q9CXK8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nip7Q9CXK8 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nip7Q9CXK8 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nip7Q9CXK8 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nip7Q9CXK8 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nip7Q9CXK8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nip7Q9CXK8 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nip7Q9CXK8 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nip7Q9CXK8 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nip7Q9CXK8 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Nip7Q9CXK8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nip7Q9CXK8 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nip7Q9CXK8 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nip7Q9CXK8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Nip7Q9CXK8 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nip7Q9CXK8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nip7Q9CXK8 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms