Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpusd4Q9CWX4 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpusd4Q9CWX4 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpusd4Q9CWX4 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpusd4Q9CWX4 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpusd4Q9CWX4 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpusd4Q9CWX4 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpusd4Q9CWX4 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpusd4Q9CWX4 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpusd4Q9CWX4 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpusd4Q9CWX4 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpusd4Q9CWX4 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpusd4Q9CWX4 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpusd4Q9CWX4 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpusd4Q9CWX4 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpusd4Q9CWX4 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpusd4Q9CWX4 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpusd4Q9CWX4 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpusd4Q9CWX4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpusd4Q9CWX4 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpusd4Q9CWX4 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpusd4Q9CWX4 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpusd4Q9CWX4 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpusd4Q9CWX4 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpusd4Q9CWX4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpusd4Q9CWX4 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpusd4Q9CWX4 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpusd4Q9CWX4 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpusd4Q9CWX4 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpusd4Q9CWX4 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpusd4Q9CWX4 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpusd4Q9CWX4 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpusd4Q9CWX4 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpusd4Q9CWX4 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpusd4Q9CWX4 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpusd4Q9CWX4 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpusd4Q9CWX4 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpusd4Q9CWX4 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpusd4Q9CWX4 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpusd4Q9CWX4 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpusd4Q9CWX4 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpusd4Q9CWX4 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpusd4Q9CWX4 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpusd4Q9CWX4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpusd4Q9CWX4 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpusd4Q9CWX4 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpusd4Q9CWX4 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpusd4Q9CWX4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpusd4Q9CWX4 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpusd4Q9CWX4 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpusd4Q9CWX4 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpusd4Q9CWX4 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpusd4Q9CWX4 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpusd4Q9CWX4 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpusd4Q9CWX4 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpusd4Q9CWX4 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpusd4Q9CWX4 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpusd4Q9CWX4 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpusd4Q9CWX4 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpusd4Q9CWX4 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpusd4Q9CWX4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpusd4Q9CWX4 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpusd4Q9CWX4 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpusd4Q9CWX4 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpusd4Q9CWX4 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpusd4Q9CWX4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpusd4Q9CWX4 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpusd4Q9CWX4 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpusd4Q9CWX4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpusd4Q9CWX4 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpusd4Q9CWX4 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpusd4Q9CWX4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpusd4Q9CWX4 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpusd4Q9CWX4 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpusd4Q9CWX4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpusd4Q9CWX4 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpusd4Q9CWX4 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpusd4Q9CWX4 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpusd4Q9CWX4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpusd4Q9CWX4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpusd4Q9CWX4 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpusd4Q9CWX4 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpusd4Q9CWX4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpusd4Q9CWX4 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpusd4Q9CWX4 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpusd4Q9CWX4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpusd4Q9CWX4 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpusd4Q9CWX4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpusd4Q9CWX4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpusd4Q9CWX4 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpusd4Q9CWX4 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpusd4Q9CWX4 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpusd4Q9CWX4 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpusd4Q9CWX4 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpusd4Q9CWX4 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpusd4Q9CWX4 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpusd4Q9CWX4 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpusd4Q9CWX4 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpusd4Q9CWX4 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpusd4Q9CWX4 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms