Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUU3

Sycp2, Synaptonemal complex protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2Q9CUU3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Sycp2Q9CUU3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Sycp2Q9CUU3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Sycp2Q9CUU3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Sycp2Q9CUU3 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
Sycp2Q9CUU3 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC34.66■■■■□ 3.14
Sycp2Q9CUU3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Sycp2Q9CUU3 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Sycp2Q9CUU3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Sycp2Q9CUU3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
Sycp2Q9CUU3 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Sycp2Q9CUU3 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
Sycp2Q9CUU3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Sycp2Q9CUU3 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Sycp2Q9CUU3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
Sycp2Q9CUU3 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Sycp2Q9CUU3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Sycp2Q9CUU3 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
Sycp2Q9CUU3 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Sycp2Q9CUU3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Sycp2Q9CUU3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Sycp2Q9CUU3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Sycp2Q9CUU3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
Sycp2Q9CUU3 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Sycp2Q9CUU3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Sycp2Q9CUU3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Sycp2Q9CUU3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Sycp2Q9CUU3 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Sycp2Q9CUU3 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Sycp2Q9CUU3 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Sycp2Q9CUU3 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
Sycp2Q9CUU3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Sycp2Q9CUU3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
Sycp2Q9CUU3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Sycp2Q9CUU3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Sycp2Q9CUU3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Sycp2Q9CUU3 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Sycp2Q9CUU3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Sycp2Q9CUU3 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Sycp2Q9CUU3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Sycp2Q9CUU3 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
Sycp2Q9CUU3 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Sycp2Q9CUU3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Sycp2Q9CUU3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Sycp2Q9CUU3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Sycp2Q9CUU3 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
Sycp2Q9CUU3 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Sycp2Q9CUU3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Sycp2Q9CUU3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Sycp2Q9CUU3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Sycp2Q9CUU3 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Sycp2Q9CUU3 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Sycp2Q9CUU3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Sycp2Q9CUU3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Sycp2Q9CUU3 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Sycp2Q9CUU3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Sycp2Q9CUU3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Sycp2Q9CUU3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Sycp2Q9CUU3 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Sycp2Q9CUU3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Sycp2Q9CUU3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Sycp2Q9CUU3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
Sycp2Q9CUU3 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Sycp2Q9CUU3 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Sycp2Q9CUU3 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Sycp2Q9CUU3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Sycp2Q9CUU3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Sycp2Q9CUU3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Sycp2Q9CUU3 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Sycp2Q9CUU3 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Sycp2Q9CUU3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Sycp2Q9CUU3 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Sycp2Q9CUU3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
Sycp2Q9CUU3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Sycp2Q9CUU3 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Sycp2Q9CUU3 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Sycp2Q9CUU3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Sycp2Q9CUU3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Sycp2Q9CUU3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Sycp2Q9CUU3 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Sycp2Q9CUU3 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Sycp2Q9CUU3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Sycp2Q9CUU3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Sycp2Q9CUU3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Sycp2Q9CUU3 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC34.51■■■■□ 3.12
Sycp2Q9CUU3 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
Sycp2Q9CUU3 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Sycp2Q9CUU3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Sycp2Q9CUU3 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Sycp2Q9CUU3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Sycp2Q9CUU3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Sycp2Q9CUU3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Sycp2Q9CUU3 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Sycp2Q9CUU3 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Sycp2Q9CUU3 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Sycp2Q9CUU3 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Sycp2Q9CUU3 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Sycp2Q9CUU3 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Sycp2Q9CUU3 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
Sycp2Q9CUU3 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms