Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg12Q9CQY1 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg12Q9CQY1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg12Q9CQY1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg12Q9CQY1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg12Q9CQY1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg12Q9CQY1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg12Q9CQY1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg12Q9CQY1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg12Q9CQY1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg12Q9CQY1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg12Q9CQY1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg12Q9CQY1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg12Q9CQY1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg12Q9CQY1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg12Q9CQY1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg12Q9CQY1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg12Q9CQY1 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg12Q9CQY1 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg12Q9CQY1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg12Q9CQY1 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg12Q9CQY1 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg12Q9CQY1 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg12Q9CQY1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Atg12Q9CQY1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg12Q9CQY1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg12Q9CQY1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg12Q9CQY1 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg12Q9CQY1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg12Q9CQY1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg12Q9CQY1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg12Q9CQY1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg12Q9CQY1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg12Q9CQY1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg12Q9CQY1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg12Q9CQY1 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg12Q9CQY1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg12Q9CQY1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg12Q9CQY1 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg12Q9CQY1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg12Q9CQY1 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg12Q9CQY1 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg12Q9CQY1 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg12Q9CQY1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg12Q9CQY1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg12Q9CQY1 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg12Q9CQY1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg12Q9CQY1 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg12Q9CQY1 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg12Q9CQY1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg12Q9CQY1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg12Q9CQY1 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg12Q9CQY1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg12Q9CQY1 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg12Q9CQY1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg12Q9CQY1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg12Q9CQY1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg12Q9CQY1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg12Q9CQY1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg12Q9CQY1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg12Q9CQY1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg12Q9CQY1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg12Q9CQY1 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg12Q9CQY1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg12Q9CQY1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg12Q9CQY1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg12Q9CQY1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg12Q9CQY1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg12Q9CQY1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg12Q9CQY1 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg12Q9CQY1 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg12Q9CQY1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg12Q9CQY1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg12Q9CQY1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg12Q9CQY1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg12Q9CQY1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg12Q9CQY1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg12Q9CQY1 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg12Q9CQY1 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg12Q9CQY1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg12Q9CQY1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg12Q9CQY1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg12Q9CQY1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg12Q9CQY1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg12Q9CQY1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg12Q9CQY1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg12Q9CQY1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg12Q9CQY1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg12Q9CQY1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg12Q9CQY1 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg12Q9CQY1 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg12Q9CQY1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg12Q9CQY1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg12Q9CQY1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg12Q9CQY1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg12Q9CQY1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg12Q9CQY1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg12Q9CQY1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg12Q9CQY1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg12Q9CQY1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms