Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW9

Ifitm3, Interferon-induced transmembrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm3Q9CQW9 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifitm3Q9CQW9 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifitm3Q9CQW9 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifitm3Q9CQW9 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifitm3Q9CQW9 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifitm3Q9CQW9 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifitm3Q9CQW9 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifitm3Q9CQW9 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifitm3Q9CQW9 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifitm3Q9CQW9 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifitm3Q9CQW9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifitm3Q9CQW9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifitm3Q9CQW9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifitm3Q9CQW9 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifitm3Q9CQW9 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifitm3Q9CQW9 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifitm3Q9CQW9 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifitm3Q9CQW9 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ifitm3Q9CQW9 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ifitm3Q9CQW9 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ifitm3Q9CQW9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ifitm3Q9CQW9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ifitm3Q9CQW9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ifitm3Q9CQW9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ifitm3Q9CQW9 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ifitm3Q9CQW9 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ifitm3Q9CQW9 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ifitm3Q9CQW9 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ifitm3Q9CQW9 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifitm3Q9CQW9 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifitm3Q9CQW9 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifitm3Q9CQW9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifitm3Q9CQW9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifitm3Q9CQW9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifitm3Q9CQW9 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifitm3Q9CQW9 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifitm3Q9CQW9 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifitm3Q9CQW9 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifitm3Q9CQW9 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifitm3Q9CQW9 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifitm3Q9CQW9 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifitm3Q9CQW9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifitm3Q9CQW9 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifitm3Q9CQW9 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifitm3Q9CQW9 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Ifitm3Q9CQW9 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifitm3Q9CQW9 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifitm3Q9CQW9 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifitm3Q9CQW9 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifitm3Q9CQW9 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifitm3Q9CQW9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifitm3Q9CQW9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifitm3Q9CQW9 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifitm3Q9CQW9 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifitm3Q9CQW9 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifitm3Q9CQW9 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifitm3Q9CQW9 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifitm3Q9CQW9 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifitm3Q9CQW9 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifitm3Q9CQW9 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifitm3Q9CQW9 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifitm3Q9CQW9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
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Ifitm3Q9CQW9 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifitm3Q9CQW9 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifitm3Q9CQW9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifitm3Q9CQW9 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifitm3Q9CQW9 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifitm3Q9CQW9 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifitm3Q9CQW9 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifitm3Q9CQW9 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifitm3Q9CQW9 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifitm3Q9CQW9 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifitm3Q9CQW9 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifitm3Q9CQW9 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifitm3Q9CQW9 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifitm3Q9CQW9 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifitm3Q9CQW9 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifitm3Q9CQW9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifitm3Q9CQW9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifitm3Q9CQW9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifitm3Q9CQW9 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifitm3Q9CQW9 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifitm3Q9CQW9 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifitm3Q9CQW9 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifitm3Q9CQW9 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifitm3Q9CQW9 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifitm3Q9CQW9 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifitm3Q9CQW9 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifitm3Q9CQW9 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifitm3Q9CQW9 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifitm3Q9CQW9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifitm3Q9CQW9 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifitm3Q9CQW9 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifitm3Q9CQW9 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifitm3Q9CQW9 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifitm3Q9CQW9 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifitm3Q9CQW9 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifitm3Q9CQW9 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms