Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ykt6Q9CQW1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ykt6Q9CQW1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ykt6Q9CQW1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ykt6Q9CQW1 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ykt6Q9CQW1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ykt6Q9CQW1 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ykt6Q9CQW1 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ykt6Q9CQW1 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ykt6Q9CQW1 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ykt6Q9CQW1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ykt6Q9CQW1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ykt6Q9CQW1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ykt6Q9CQW1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ykt6Q9CQW1 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ykt6Q9CQW1 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ykt6Q9CQW1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ykt6Q9CQW1 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ykt6Q9CQW1 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ykt6Q9CQW1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ykt6Q9CQW1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ykt6Q9CQW1 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ykt6Q9CQW1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ykt6Q9CQW1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ykt6Q9CQW1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ykt6Q9CQW1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ykt6Q9CQW1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ykt6Q9CQW1 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ykt6Q9CQW1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ykt6Q9CQW1 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ykt6Q9CQW1 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ykt6Q9CQW1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ykt6Q9CQW1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ykt6Q9CQW1 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ykt6Q9CQW1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ykt6Q9CQW1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ykt6Q9CQW1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ykt6Q9CQW1 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ykt6Q9CQW1 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ykt6Q9CQW1 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ykt6Q9CQW1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ykt6Q9CQW1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ykt6Q9CQW1 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ykt6Q9CQW1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ykt6Q9CQW1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ykt6Q9CQW1 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ykt6Q9CQW1 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ykt6Q9CQW1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ykt6Q9CQW1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ykt6Q9CQW1 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ykt6Q9CQW1 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ykt6Q9CQW1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ykt6Q9CQW1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ykt6Q9CQW1 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ykt6Q9CQW1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ykt6Q9CQW1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ykt6Q9CQW1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ykt6Q9CQW1 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ykt6Q9CQW1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ykt6Q9CQW1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ykt6Q9CQW1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ykt6Q9CQW1 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ykt6Q9CQW1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ykt6Q9CQW1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ykt6Q9CQW1 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ykt6Q9CQW1 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ykt6Q9CQW1 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ykt6Q9CQW1 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ykt6Q9CQW1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ykt6Q9CQW1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ykt6Q9CQW1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ykt6Q9CQW1 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ykt6Q9CQW1 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ykt6Q9CQW1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ykt6Q9CQW1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ykt6Q9CQW1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ykt6Q9CQW1 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ykt6Q9CQW1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ykt6Q9CQW1 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ykt6Q9CQW1 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ykt6Q9CQW1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ykt6Q9CQW1 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ykt6Q9CQW1 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ykt6Q9CQW1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ykt6Q9CQW1 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ykt6Q9CQW1 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ykt6Q9CQW1 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ykt6Q9CQW1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ykt6Q9CQW1 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ykt6Q9CQW1 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ykt6Q9CQW1 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ykt6Q9CQW1 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ykt6Q9CQW1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ykt6Q9CQW1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ykt6Q9CQW1 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ykt6Q9CQW1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ykt6Q9CQW1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ykt6Q9CQW1 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ykt6Q9CQW1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ykt6Q9CQW1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms