Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQI9

Med30, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 30, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med30Q9CQI9 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Med30Q9CQI9 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Med30Q9CQI9 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Med30Q9CQI9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Med30Q9CQI9 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Med30Q9CQI9 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Med30Q9CQI9 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Med30Q9CQI9 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Med30Q9CQI9 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Med30Q9CQI9 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Med30Q9CQI9 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Med30Q9CQI9 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Med30Q9CQI9 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Med30Q9CQI9 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Med30Q9CQI9 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Med30Q9CQI9 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Med30Q9CQI9 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Med30Q9CQI9 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Med30Q9CQI9 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Med30Q9CQI9 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Med30Q9CQI9 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Med30Q9CQI9 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Med30Q9CQI9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Med30Q9CQI9 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Med30Q9CQI9 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Med30Q9CQI9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Med30Q9CQI9 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Med30Q9CQI9 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Med30Q9CQI9 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Med30Q9CQI9 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Med30Q9CQI9 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Med30Q9CQI9 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Med30Q9CQI9 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Med30Q9CQI9 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Med30Q9CQI9 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Med30Q9CQI9 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Med30Q9CQI9 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Med30Q9CQI9 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Med30Q9CQI9 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Med30Q9CQI9 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Med30Q9CQI9 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Med30Q9CQI9 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Med30Q9CQI9 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Med30Q9CQI9 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Med30Q9CQI9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Med30Q9CQI9 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Med30Q9CQI9 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Med30Q9CQI9 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Med30Q9CQI9 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Med30Q9CQI9 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Med30Q9CQI9 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Med30Q9CQI9 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Med30Q9CQI9 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Med30Q9CQI9 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Med30Q9CQI9 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Med30Q9CQI9 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Med30Q9CQI9 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Med30Q9CQI9 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Med30Q9CQI9 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Med30Q9CQI9 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Med30Q9CQI9 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Med30Q9CQI9 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Med30Q9CQI9 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Med30Q9CQI9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Med30Q9CQI9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Med30Q9CQI9 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Med30Q9CQI9 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Med30Q9CQI9 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Med30Q9CQI9 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Med30Q9CQI9 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Med30Q9CQI9 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Med30Q9CQI9 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Med30Q9CQI9 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Med30Q9CQI9 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Med30Q9CQI9 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Med30Q9CQI9 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Med30Q9CQI9 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Med30Q9CQI9 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Med30Q9CQI9 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Med30Q9CQI9 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Med30Q9CQI9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Med30Q9CQI9 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Med30Q9CQI9 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Med30Q9CQI9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Med30Q9CQI9 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Med30Q9CQI9 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Med30Q9CQI9 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Med30Q9CQI9 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Med30Q9CQI9 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Med30Q9CQI9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Med30Q9CQI9 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Med30Q9CQI9 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Med30Q9CQI9 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Med30Q9CQI9 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Med30Q9CQI9 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Med30Q9CQI9 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Med30Q9CQI9 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Med30Q9CQI9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Med30Q9CQI9 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Med30Q9CQI9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms