Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA5

Med4, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med4Q9CQA5 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Med4Q9CQA5 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Med4Q9CQA5 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Med4Q9CQA5 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Med4Q9CQA5 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Med4Q9CQA5 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Med4Q9CQA5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Med4Q9CQA5 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Med4Q9CQA5 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Med4Q9CQA5 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Med4Q9CQA5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Med4Q9CQA5 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Med4Q9CQA5 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Med4Q9CQA5 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Med4Q9CQA5 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Med4Q9CQA5 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Med4Q9CQA5 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Med4Q9CQA5 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Med4Q9CQA5 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Med4Q9CQA5 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Med4Q9CQA5 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Med4Q9CQA5 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Med4Q9CQA5 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Med4Q9CQA5 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Med4Q9CQA5 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Med4Q9CQA5 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Med4Q9CQA5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Med4Q9CQA5 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Med4Q9CQA5 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.32■■□□□ 1
Med4Q9CQA5 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Med4Q9CQA5 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Med4Q9CQA5 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Med4Q9CQA5 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Med4Q9CQA5 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Med4Q9CQA5 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Med4Q9CQA5 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Med4Q9CQA5 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Med4Q9CQA5 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Med4Q9CQA5 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Med4Q9CQA5 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Med4Q9CQA5 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Med4Q9CQA5 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Med4Q9CQA5 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Med4Q9CQA5 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Med4Q9CQA5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Med4Q9CQA5 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Med4Q9CQA5 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Med4Q9CQA5 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Med4Q9CQA5 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Med4Q9CQA5 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC21.31■■□□□ 1
Med4Q9CQA5 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Med4Q9CQA5 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Med4Q9CQA5 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Med4Q9CQA5 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Med4Q9CQA5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Med4Q9CQA5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Med4Q9CQA5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Med4Q9CQA5 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Med4Q9CQA5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Med4Q9CQA5 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Med4Q9CQA5 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Med4Q9CQA5 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Med4Q9CQA5 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Med4Q9CQA5 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Med4Q9CQA5 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Med4Q9CQA5 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Med4Q9CQA5 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Med4Q9CQA5 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Med4Q9CQA5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Med4Q9CQA5 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Med4Q9CQA5 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Med4Q9CQA5 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Med4Q9CQA5 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Med4Q9CQA5 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Med4Q9CQA5 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Med4Q9CQA5 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Med4Q9CQA5 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Med4Q9CQA5 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Med4Q9CQA5 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Med4Q9CQA5 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Med4Q9CQA5 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Med4Q9CQA5 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Med4Q9CQA5 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Med4Q9CQA5 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Med4Q9CQA5 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Med4Q9CQA5 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Med4Q9CQA5 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Med4Q9CQA5 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Med4Q9CQA5 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Med4Q9CQA5 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Med4Q9CQA5 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Med4Q9CQA5 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Med4Q9CQA5 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Med4Q9CQA5 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Med4Q9CQA5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Med4Q9CQA5 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Med4Q9CQA5 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Med4Q9CQA5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Med4Q9CQA5 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Med4Q9CQA5 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms