Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ82

Itgb3bp, Centromere protein R, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3bpQ9CQ82 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itgb3bpQ9CQ82 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itgb3bpQ9CQ82 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itgb3bpQ9CQ82 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Itgb3bpQ9CQ82 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itgb3bpQ9CQ82 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itgb3bpQ9CQ82 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itgb3bpQ9CQ82 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itgb3bpQ9CQ82 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Itgb3bpQ9CQ82 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itgb3bpQ9CQ82 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itgb3bpQ9CQ82 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itgb3bpQ9CQ82 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itgb3bpQ9CQ82 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itgb3bpQ9CQ82 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itgb3bpQ9CQ82 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itgb3bpQ9CQ82 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itgb3bpQ9CQ82 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itgb3bpQ9CQ82 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itgb3bpQ9CQ82 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itgb3bpQ9CQ82 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itgb3bpQ9CQ82 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itgb3bpQ9CQ82 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itgb3bpQ9CQ82 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itgb3bpQ9CQ82 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itgb3bpQ9CQ82 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itgb3bpQ9CQ82 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itgb3bpQ9CQ82 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itgb3bpQ9CQ82 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itgb3bpQ9CQ82 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itgb3bpQ9CQ82 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itgb3bpQ9CQ82 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itgb3bpQ9CQ82 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itgb3bpQ9CQ82 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Itgb3bpQ9CQ82 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itgb3bpQ9CQ82 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itgb3bpQ9CQ82 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Itgb3bpQ9CQ82 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itgb3bpQ9CQ82 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itgb3bpQ9CQ82 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itgb3bpQ9CQ82 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itgb3bpQ9CQ82 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itgb3bpQ9CQ82 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itgb3bpQ9CQ82 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itgb3bpQ9CQ82 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itgb3bpQ9CQ82 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itgb3bpQ9CQ82 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itgb3bpQ9CQ82 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itgb3bpQ9CQ82 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itgb3bpQ9CQ82 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itgb3bpQ9CQ82 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itgb3bpQ9CQ82 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itgb3bpQ9CQ82 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itgb3bpQ9CQ82 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itgb3bpQ9CQ82 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itgb3bpQ9CQ82 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itgb3bpQ9CQ82 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itgb3bpQ9CQ82 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itgb3bpQ9CQ82 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itgb3bpQ9CQ82 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itgb3bpQ9CQ82 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itgb3bpQ9CQ82 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itgb3bpQ9CQ82 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itgb3bpQ9CQ82 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb3bpQ9CQ82 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb3bpQ9CQ82 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb3bpQ9CQ82 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb3bpQ9CQ82 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb3bpQ9CQ82 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb3bpQ9CQ82 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb3bpQ9CQ82 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb3bpQ9CQ82 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb3bpQ9CQ82 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb3bpQ9CQ82 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb3bpQ9CQ82 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb3bpQ9CQ82 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb3bpQ9CQ82 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb3bpQ9CQ82 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb3bpQ9CQ82 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb3bpQ9CQ82 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb3bpQ9CQ82 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb3bpQ9CQ82 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb3bpQ9CQ82 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb3bpQ9CQ82 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb3bpQ9CQ82 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb3bpQ9CQ82 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb3bpQ9CQ82 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb3bpQ9CQ82 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb3bpQ9CQ82 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb3bpQ9CQ82 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb3bpQ9CQ82 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb3bpQ9CQ82 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb3bpQ9CQ82 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb3bpQ9CQ82 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb3bpQ9CQ82 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb3bpQ9CQ82 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb3bpQ9CQ82 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb3bpQ9CQ82 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb3bpQ9CQ82 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb3bpQ9CQ82 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms