Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700029P11RikQ9CQ68 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700029P11RikQ9CQ68 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
1700029P11RikQ9CQ68 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16■□□□□ 0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700029P11RikQ9CQ68 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms