Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ11

2010109I03Rik, RIKEN cDNA 2010109I03, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2010109I03RikQ9CQ11 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
2010109I03RikQ9CQ11 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
2010109I03RikQ9CQ11 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
2010109I03RikQ9CQ11 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
2010109I03RikQ9CQ11 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
2010109I03RikQ9CQ11 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
2010109I03RikQ9CQ11 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
2010109I03RikQ9CQ11 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
2010109I03RikQ9CQ11 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
2010109I03RikQ9CQ11 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
2010109I03RikQ9CQ11 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
2010109I03RikQ9CQ11 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
2010109I03RikQ9CQ11 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
2010109I03RikQ9CQ11 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
2010109I03RikQ9CQ11 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
2010109I03RikQ9CQ11 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
2010109I03RikQ9CQ11 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
2010109I03RikQ9CQ11 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
2010109I03RikQ9CQ11 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
2010109I03RikQ9CQ11 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
2010109I03RikQ9CQ11 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
2010109I03RikQ9CQ11 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
2010109I03RikQ9CQ11 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
2010109I03RikQ9CQ11 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
2010109I03RikQ9CQ11 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
2010109I03RikQ9CQ11 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
2010109I03RikQ9CQ11 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
2010109I03RikQ9CQ11 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
2010109I03RikQ9CQ11 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
2010109I03RikQ9CQ11 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
2010109I03RikQ9CQ11 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
2010109I03RikQ9CQ11 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
2010109I03RikQ9CQ11 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
2010109I03RikQ9CQ11 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
2010109I03RikQ9CQ11 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
2010109I03RikQ9CQ11 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
2010109I03RikQ9CQ11 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
2010109I03RikQ9CQ11 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
2010109I03RikQ9CQ11 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
2010109I03RikQ9CQ11 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
2010109I03RikQ9CQ11 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
2010109I03RikQ9CQ11 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
2010109I03RikQ9CQ11 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
2010109I03RikQ9CQ11 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
2010109I03RikQ9CQ11 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
2010109I03RikQ9CQ11 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
2010109I03RikQ9CQ11 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
2010109I03RikQ9CQ11 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
2010109I03RikQ9CQ11 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
2010109I03RikQ9CQ11 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
2010109I03RikQ9CQ11 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
2010109I03RikQ9CQ11 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
2010109I03RikQ9CQ11 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
2010109I03RikQ9CQ11 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
2010109I03RikQ9CQ11 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
2010109I03RikQ9CQ11 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
2010109I03RikQ9CQ11 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
2010109I03RikQ9CQ11 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
2010109I03RikQ9CQ11 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
2010109I03RikQ9CQ11 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
2010109I03RikQ9CQ11 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
2010109I03RikQ9CQ11 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
2010109I03RikQ9CQ11 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
2010109I03RikQ9CQ11 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
2010109I03RikQ9CQ11 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
2010109I03RikQ9CQ11 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
2010109I03RikQ9CQ11 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
2010109I03RikQ9CQ11 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
2010109I03RikQ9CQ11 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
2010109I03RikQ9CQ11 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
2010109I03RikQ9CQ11 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
2010109I03RikQ9CQ11 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
2010109I03RikQ9CQ11 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
2010109I03RikQ9CQ11 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
2010109I03RikQ9CQ11 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
2010109I03RikQ9CQ11 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
2010109I03RikQ9CQ11 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
2010109I03RikQ9CQ11 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
2010109I03RikQ9CQ11 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
2010109I03RikQ9CQ11 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
2010109I03RikQ9CQ11 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
2010109I03RikQ9CQ11 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
2010109I03RikQ9CQ11 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
2010109I03RikQ9CQ11 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
2010109I03RikQ9CQ11 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
2010109I03RikQ9CQ11 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
2010109I03RikQ9CQ11 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
2010109I03RikQ9CQ11 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
2010109I03RikQ9CQ11 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
2010109I03RikQ9CQ11 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
2010109I03RikQ9CQ11 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
2010109I03RikQ9CQ11 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
2010109I03RikQ9CQ11 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
2010109I03RikQ9CQ11 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
2010109I03RikQ9CQ11 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
2010109I03RikQ9CQ11 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
2010109I03RikQ9CQ11 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
2010109I03RikQ9CQ11 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
2010109I03RikQ9CQ11 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
2010109I03RikQ9CQ11 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms