Protein–RNA interactions for Protein: Q99PJ2

Trim8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim8Q99PJ2 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim8Q99PJ2 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim8Q99PJ2 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim8Q99PJ2 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim8Q99PJ2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim8Q99PJ2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim8Q99PJ2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim8Q99PJ2 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim8Q99PJ2 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim8Q99PJ2 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim8Q99PJ2 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim8Q99PJ2 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim8Q99PJ2 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim8Q99PJ2 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim8Q99PJ2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim8Q99PJ2 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim8Q99PJ2 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim8Q99PJ2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim8Q99PJ2 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim8Q99PJ2 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim8Q99PJ2 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim8Q99PJ2 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim8Q99PJ2 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim8Q99PJ2 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim8Q99PJ2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim8Q99PJ2 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim8Q99PJ2 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim8Q99PJ2 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim8Q99PJ2 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim8Q99PJ2 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim8Q99PJ2 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim8Q99PJ2 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim8Q99PJ2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim8Q99PJ2 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim8Q99PJ2 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim8Q99PJ2 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim8Q99PJ2 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim8Q99PJ2 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim8Q99PJ2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim8Q99PJ2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim8Q99PJ2 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim8Q99PJ2 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim8Q99PJ2 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim8Q99PJ2 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim8Q99PJ2 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim8Q99PJ2 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim8Q99PJ2 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim8Q99PJ2 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim8Q99PJ2 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim8Q99PJ2 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim8Q99PJ2 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim8Q99PJ2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim8Q99PJ2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim8Q99PJ2 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim8Q99PJ2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim8Q99PJ2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim8Q99PJ2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim8Q99PJ2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim8Q99PJ2 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim8Q99PJ2 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim8Q99PJ2 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim8Q99PJ2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim8Q99PJ2 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim8Q99PJ2 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim8Q99PJ2 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim8Q99PJ2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim8Q99PJ2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim8Q99PJ2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim8Q99PJ2 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim8Q99PJ2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim8Q99PJ2 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim8Q99PJ2 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim8Q99PJ2 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim8Q99PJ2 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim8Q99PJ2 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim8Q99PJ2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Trim8Q99PJ2 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Trim8Q99PJ2 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim8Q99PJ2 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim8Q99PJ2 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim8Q99PJ2 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim8Q99PJ2 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim8Q99PJ2 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim8Q99PJ2 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim8Q99PJ2 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim8Q99PJ2 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim8Q99PJ2 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim8Q99PJ2 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim8Q99PJ2 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim8Q99PJ2 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim8Q99PJ2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim8Q99PJ2 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim8Q99PJ2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim8Q99PJ2 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim8Q99PJ2 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim8Q99PJ2 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim8Q99PJ2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim8Q99PJ2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim8Q99PJ2 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim8Q99PJ2 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms