Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF1

Bco2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, mousemouse

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco2Q99NF1 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Bco2Q99NF1 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Bco2Q99NF1 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Bco2Q99NF1 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Bco2Q99NF1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Bco2Q99NF1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Bco2Q99NF1 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Bco2Q99NF1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bco2Q99NF1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bco2Q99NF1 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bco2Q99NF1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bco2Q99NF1 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bco2Q99NF1 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bco2Q99NF1 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Bco2Q99NF1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bco2Q99NF1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bco2Q99NF1 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bco2Q99NF1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bco2Q99NF1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bco2Q99NF1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Bco2Q99NF1 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Bco2Q99NF1 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Bco2Q99NF1 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Bco2Q99NF1 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Bco2Q99NF1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Bco2Q99NF1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Bco2Q99NF1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Bco2Q99NF1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Bco2Q99NF1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Bco2Q99NF1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bco2Q99NF1 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Bco2Q99NF1 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bco2Q99NF1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bco2Q99NF1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bco2Q99NF1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bco2Q99NF1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bco2Q99NF1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bco2Q99NF1 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bco2Q99NF1 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Bco2Q99NF1 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bco2Q99NF1 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bco2Q99NF1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bco2Q99NF1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bco2Q99NF1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bco2Q99NF1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bco2Q99NF1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Bco2Q99NF1 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Bco2Q99NF1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Bco2Q99NF1 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Bco2Q99NF1 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Bco2Q99NF1 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Bco2Q99NF1 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Bco2Q99NF1 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Bco2Q99NF1 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Bco2Q99NF1 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Bco2Q99NF1 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Bco2Q99NF1 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Bco2Q99NF1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Bco2Q99NF1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Bco2Q99NF1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Bco2Q99NF1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Bco2Q99NF1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Bco2Q99NF1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Bco2Q99NF1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Bco2Q99NF1 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Bco2Q99NF1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Bco2Q99NF1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Bco2Q99NF1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Bco2Q99NF1 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Bco2Q99NF1 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Bco2Q99NF1 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Bco2Q99NF1 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Bco2Q99NF1 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Bco2Q99NF1 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Bco2Q99NF1 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Bco2Q99NF1 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Bco2Q99NF1 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Bco2Q99NF1 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Bco2Q99NF1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Bco2Q99NF1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Bco2Q99NF1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Bco2Q99NF1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Bco2Q99NF1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Bco2Q99NF1 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Bco2Q99NF1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Bco2Q99NF1 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Bco2Q99NF1 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Bco2Q99NF1 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Bco2Q99NF1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Bco2Q99NF1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Bco2Q99NF1 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Bco2Q99NF1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Bco2Q99NF1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Bco2Q99NF1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Bco2Q99NF1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Bco2Q99NF1 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Bco2Q99NF1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Bco2Q99NF1 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Bco2Q99NF1 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Bco2Q99NF1 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
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