Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA2

Atoh8, Protein atonal homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh8Q99NA2 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atoh8Q99NA2 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atoh8Q99NA2 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atoh8Q99NA2 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atoh8Q99NA2 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atoh8Q99NA2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atoh8Q99NA2 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atoh8Q99NA2 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atoh8Q99NA2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atoh8Q99NA2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atoh8Q99NA2 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atoh8Q99NA2 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atoh8Q99NA2 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atoh8Q99NA2 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atoh8Q99NA2 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atoh8Q99NA2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atoh8Q99NA2 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atoh8Q99NA2 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atoh8Q99NA2 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atoh8Q99NA2 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Atoh8Q99NA2 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atoh8Q99NA2 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atoh8Q99NA2 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Atoh8Q99NA2 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atoh8Q99NA2 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atoh8Q99NA2 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atoh8Q99NA2 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Atoh8Q99NA2 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atoh8Q99NA2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atoh8Q99NA2 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atoh8Q99NA2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atoh8Q99NA2 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atoh8Q99NA2 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atoh8Q99NA2 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atoh8Q99NA2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atoh8Q99NA2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atoh8Q99NA2 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atoh8Q99NA2 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atoh8Q99NA2 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Atoh8Q99NA2 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atoh8Q99NA2 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atoh8Q99NA2 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atoh8Q99NA2 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atoh8Q99NA2 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atoh8Q99NA2 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atoh8Q99NA2 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atoh8Q99NA2 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atoh8Q99NA2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atoh8Q99NA2 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Atoh8Q99NA2 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atoh8Q99NA2 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atoh8Q99NA2 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atoh8Q99NA2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atoh8Q99NA2 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atoh8Q99NA2 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atoh8Q99NA2 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atoh8Q99NA2 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atoh8Q99NA2 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atoh8Q99NA2 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atoh8Q99NA2 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atoh8Q99NA2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atoh8Q99NA2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atoh8Q99NA2 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atoh8Q99NA2 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Atoh8Q99NA2 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atoh8Q99NA2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atoh8Q99NA2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atoh8Q99NA2 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atoh8Q99NA2 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atoh8Q99NA2 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Atoh8Q99NA2 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atoh8Q99NA2 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atoh8Q99NA2 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atoh8Q99NA2 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atoh8Q99NA2 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atoh8Q99NA2 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atoh8Q99NA2 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atoh8Q99NA2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atoh8Q99NA2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atoh8Q99NA2 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atoh8Q99NA2 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atoh8Q99NA2 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atoh8Q99NA2 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Atoh8Q99NA2 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atoh8Q99NA2 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Atoh8Q99NA2 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atoh8Q99NA2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atoh8Q99NA2 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Atoh8Q99NA2 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atoh8Q99NA2 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atoh8Q99NA2 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atoh8Q99NA2 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atoh8Q99NA2 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Atoh8Q99NA2 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atoh8Q99NA2 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atoh8Q99NA2 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atoh8Q99NA2 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atoh8Q99NA2 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atoh8Q99NA2 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atoh8Q99NA2 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 180.9 ms