Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR8

Mccc1, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mccc1Q99MR8 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mccc1Q99MR8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mccc1Q99MR8 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mccc1Q99MR8 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mccc1Q99MR8 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mccc1Q99MR8 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mccc1Q99MR8 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mccc1Q99MR8 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mccc1Q99MR8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mccc1Q99MR8 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mccc1Q99MR8 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mccc1Q99MR8 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mccc1Q99MR8 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mccc1Q99MR8 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Mccc1Q99MR8 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mccc1Q99MR8 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mccc1Q99MR8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mccc1Q99MR8 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mccc1Q99MR8 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Mccc1Q99MR8 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Mccc1Q99MR8 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Mccc1Q99MR8 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mccc1Q99MR8 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mccc1Q99MR8 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mccc1Q99MR8 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mccc1Q99MR8 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Mccc1Q99MR8 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mccc1Q99MR8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mccc1Q99MR8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mccc1Q99MR8 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mccc1Q99MR8 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mccc1Q99MR8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mccc1Q99MR8 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mccc1Q99MR8 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mccc1Q99MR8 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mccc1Q99MR8 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mccc1Q99MR8 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mccc1Q99MR8 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mccc1Q99MR8 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mccc1Q99MR8 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mccc1Q99MR8 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mccc1Q99MR8 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mccc1Q99MR8 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mccc1Q99MR8 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mccc1Q99MR8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Mccc1Q99MR8 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mccc1Q99MR8 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mccc1Q99MR8 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Mccc1Q99MR8 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mccc1Q99MR8 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mccc1Q99MR8 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mccc1Q99MR8 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mccc1Q99MR8 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mccc1Q99MR8 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mccc1Q99MR8 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mccc1Q99MR8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mccc1Q99MR8 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mccc1Q99MR8 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mccc1Q99MR8 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mccc1Q99MR8 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mccc1Q99MR8 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mccc1Q99MR8 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mccc1Q99MR8 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mccc1Q99MR8 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mccc1Q99MR8 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mccc1Q99MR8 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mccc1Q99MR8 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mccc1Q99MR8 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mccc1Q99MR8 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mccc1Q99MR8 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mccc1Q99MR8 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mccc1Q99MR8 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mccc1Q99MR8 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mccc1Q99MR8 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mccc1Q99MR8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mccc1Q99MR8 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mccc1Q99MR8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mccc1Q99MR8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mccc1Q99MR8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mccc1Q99MR8 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mccc1Q99MR8 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mccc1Q99MR8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mccc1Q99MR8 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mccc1Q99MR8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mccc1Q99MR8 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mccc1Q99MR8 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mccc1Q99MR8 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mccc1Q99MR8 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mccc1Q99MR8 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mccc1Q99MR8 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mccc1Q99MR8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mccc1Q99MR8 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mccc1Q99MR8 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mccc1Q99MR8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mccc1Q99MR8 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mccc1Q99MR8 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mccc1Q99MR8 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mccc1Q99MR8 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mccc1Q99MR8 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mccc1Q99MR8 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms