Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR3

Slc12a9, Solute carrier family 12 member 9, mousemouse

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a9Q99MR3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc12a9Q99MR3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc12a9Q99MR3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc12a9Q99MR3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc12a9Q99MR3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc12a9Q99MR3 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc12a9Q99MR3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc12a9Q99MR3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc12a9Q99MR3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc12a9Q99MR3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc12a9Q99MR3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc12a9Q99MR3 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc12a9Q99MR3 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc12a9Q99MR3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc12a9Q99MR3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc12a9Q99MR3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc12a9Q99MR3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc12a9Q99MR3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc12a9Q99MR3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc12a9Q99MR3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc12a9Q99MR3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc12a9Q99MR3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc12a9Q99MR3 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc12a9Q99MR3 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc12a9Q99MR3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc12a9Q99MR3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc12a9Q99MR3 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc12a9Q99MR3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc12a9Q99MR3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc12a9Q99MR3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc12a9Q99MR3 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc12a9Q99MR3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc12a9Q99MR3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc12a9Q99MR3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc12a9Q99MR3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc12a9Q99MR3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc12a9Q99MR3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc12a9Q99MR3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc12a9Q99MR3 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc12a9Q99MR3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc12a9Q99MR3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc12a9Q99MR3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc12a9Q99MR3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc12a9Q99MR3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc12a9Q99MR3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc12a9Q99MR3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc12a9Q99MR3 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc12a9Q99MR3 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc12a9Q99MR3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc12a9Q99MR3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc12a9Q99MR3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc12a9Q99MR3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc12a9Q99MR3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc12a9Q99MR3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc12a9Q99MR3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc12a9Q99MR3 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc12a9Q99MR3 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc12a9Q99MR3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc12a9Q99MR3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc12a9Q99MR3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc12a9Q99MR3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc12a9Q99MR3 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc12a9Q99MR3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc12a9Q99MR3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc12a9Q99MR3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc12a9Q99MR3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc12a9Q99MR3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc12a9Q99MR3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc12a9Q99MR3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc12a9Q99MR3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc12a9Q99MR3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc12a9Q99MR3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc12a9Q99MR3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc12a9Q99MR3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc12a9Q99MR3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc12a9Q99MR3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc12a9Q99MR3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc12a9Q99MR3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc12a9Q99MR3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc12a9Q99MR3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc12a9Q99MR3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc12a9Q99MR3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc12a9Q99MR3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc12a9Q99MR3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc12a9Q99MR3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc12a9Q99MR3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc12a9Q99MR3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc12a9Q99MR3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc12a9Q99MR3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc12a9Q99MR3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc12a9Q99MR3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc12a9Q99MR3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc12a9Q99MR3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc12a9Q99MR3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc12a9Q99MR3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc12a9Q99MR3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc12a9Q99MR3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc12a9Q99MR3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc12a9Q99MR3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc12a9Q99MR3 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms