Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ8

Nus1, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Nus1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nus1Q99LJ8 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nus1Q99LJ8 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nus1Q99LJ8 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nus1Q99LJ8 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nus1Q99LJ8 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nus1Q99LJ8 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nus1Q99LJ8 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nus1Q99LJ8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nus1Q99LJ8 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nus1Q99LJ8 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nus1Q99LJ8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nus1Q99LJ8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nus1Q99LJ8 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nus1Q99LJ8 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nus1Q99LJ8 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nus1Q99LJ8 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nus1Q99LJ8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nus1Q99LJ8 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nus1Q99LJ8 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nus1Q99LJ8 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nus1Q99LJ8 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nus1Q99LJ8 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nus1Q99LJ8 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nus1Q99LJ8 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nus1Q99LJ8 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nus1Q99LJ8 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nus1Q99LJ8 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nus1Q99LJ8 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nus1Q99LJ8 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nus1Q99LJ8 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nus1Q99LJ8 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nus1Q99LJ8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nus1Q99LJ8 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nus1Q99LJ8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nus1Q99LJ8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nus1Q99LJ8 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nus1Q99LJ8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nus1Q99LJ8 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nus1Q99LJ8 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nus1Q99LJ8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nus1Q99LJ8 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nus1Q99LJ8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nus1Q99LJ8 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nus1Q99LJ8 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nus1Q99LJ8 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nus1Q99LJ8 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nus1Q99LJ8 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nus1Q99LJ8 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nus1Q99LJ8 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nus1Q99LJ8 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nus1Q99LJ8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nus1Q99LJ8 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nus1Q99LJ8 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nus1Q99LJ8 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nus1Q99LJ8 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nus1Q99LJ8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nus1Q99LJ8 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nus1Q99LJ8 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nus1Q99LJ8 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nus1Q99LJ8 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nus1Q99LJ8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nus1Q99LJ8 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nus1Q99LJ8 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nus1Q99LJ8 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nus1Q99LJ8 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nus1Q99LJ8 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nus1Q99LJ8 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nus1Q99LJ8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nus1Q99LJ8 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nus1Q99LJ8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nus1Q99LJ8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nus1Q99LJ8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nus1Q99LJ8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nus1Q99LJ8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nus1Q99LJ8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nus1Q99LJ8 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nus1Q99LJ8 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nus1Q99LJ8 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nus1Q99LJ8 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nus1Q99LJ8 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nus1Q99LJ8 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nus1Q99LJ8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nus1Q99LJ8 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nus1Q99LJ8 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nus1Q99LJ8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nus1Q99LJ8 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nus1Q99LJ8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nus1Q99LJ8 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nus1Q99LJ8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nus1Q99LJ8 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nus1Q99LJ8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nus1Q99LJ8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nus1Q99LJ8 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nus1Q99LJ8 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nus1Q99LJ8 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nus1Q99LJ8 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nus1Q99LJ8 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nus1Q99LJ8 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nus1Q99LJ8 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nus1Q99LJ8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.7 ms