Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sh3bp5lQ99LH9 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sh3bp5lQ99LH9 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sh3bp5lQ99LH9 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sh3bp5lQ99LH9 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sh3bp5lQ99LH9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sh3bp5lQ99LH9 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Sh3bp5lQ99LH9 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sh3bp5lQ99LH9 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sh3bp5lQ99LH9 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sh3bp5lQ99LH9 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sh3bp5lQ99LH9 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sh3bp5lQ99LH9 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Sh3bp5lQ99LH9 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Sh3bp5lQ99LH9 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sh3bp5lQ99LH9 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sh3bp5lQ99LH9 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sh3bp5lQ99LH9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sh3bp5lQ99LH9 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sh3bp5lQ99LH9 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sh3bp5lQ99LH9 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sh3bp5lQ99LH9 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sh3bp5lQ99LH9 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sh3bp5lQ99LH9 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sh3bp5lQ99LH9 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sh3bp5lQ99LH9 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sh3bp5lQ99LH9 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sh3bp5lQ99LH9 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sh3bp5lQ99LH9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sh3bp5lQ99LH9 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sh3bp5lQ99LH9 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sh3bp5lQ99LH9 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sh3bp5lQ99LH9 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sh3bp5lQ99LH9 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Sh3bp5lQ99LH9 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Sh3bp5lQ99LH9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sh3bp5lQ99LH9 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sh3bp5lQ99LH9 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sh3bp5lQ99LH9 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Sh3bp5lQ99LH9 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sh3bp5lQ99LH9 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sh3bp5lQ99LH9 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sh3bp5lQ99LH9 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sh3bp5lQ99LH9 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sh3bp5lQ99LH9 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sh3bp5lQ99LH9 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Sh3bp5lQ99LH9 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sh3bp5lQ99LH9 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sh3bp5lQ99LH9 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sh3bp5lQ99LH9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sh3bp5lQ99LH9 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sh3bp5lQ99LH9 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Sh3bp5lQ99LH9 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Sh3bp5lQ99LH9 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sh3bp5lQ99LH9 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sh3bp5lQ99LH9 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sh3bp5lQ99LH9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sh3bp5lQ99LH9 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sh3bp5lQ99LH9 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Sh3bp5lQ99LH9 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sh3bp5lQ99LH9 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Sh3bp5lQ99LH9 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sh3bp5lQ99LH9 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sh3bp5lQ99LH9 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sh3bp5lQ99LH9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sh3bp5lQ99LH9 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sh3bp5lQ99LH9 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sh3bp5lQ99LH9 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sh3bp5lQ99LH9 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sh3bp5lQ99LH9 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Sh3bp5lQ99LH9 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sh3bp5lQ99LH9 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sh3bp5lQ99LH9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sh3bp5lQ99LH9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sh3bp5lQ99LH9 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sh3bp5lQ99LH9 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sh3bp5lQ99LH9 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sh3bp5lQ99LH9 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sh3bp5lQ99LH9 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Sh3bp5lQ99LH9 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Sh3bp5lQ99LH9 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sh3bp5lQ99LH9 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sh3bp5lQ99LH9 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Sh3bp5lQ99LH9 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sh3bp5lQ99LH9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sh3bp5lQ99LH9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sh3bp5lQ99LH9 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sh3bp5lQ99LH9 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sh3bp5lQ99LH9 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sh3bp5lQ99LH9 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Sh3bp5lQ99LH9 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sh3bp5lQ99LH9 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sh3bp5lQ99LH9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sh3bp5lQ99LH9 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sh3bp5lQ99LH9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sh3bp5lQ99LH9 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sh3bp5lQ99LH9 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sh3bp5lQ99LH9 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Sh3bp5lQ99LH9 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sh3bp5lQ99LH9 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
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