Protein–RNA interactions for Protein: Q99KW3

Triobp, TRIO and F-actin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TriobpQ99KW3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
TriobpQ99KW3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TriobpQ99KW3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TriobpQ99KW3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TriobpQ99KW3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.64■□□□□ 0.74
TriobpQ99KW3 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
TriobpQ99KW3 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
TriobpQ99KW3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
TriobpQ99KW3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
TriobpQ99KW3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TriobpQ99KW3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TriobpQ99KW3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TriobpQ99KW3 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TriobpQ99KW3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TriobpQ99KW3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TriobpQ99KW3 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
TriobpQ99KW3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TriobpQ99KW3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TriobpQ99KW3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TriobpQ99KW3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TriobpQ99KW3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TriobpQ99KW3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TriobpQ99KW3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms