Protein–RNA interactions for Protein: Q99KW3

Triobp, TRIO and F-actin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,014 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TriobpQ99KW3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
TriobpQ99KW3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TriobpQ99KW3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TriobpQ99KW3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TriobpQ99KW3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.64■□□□□ 0.74
TriobpQ99KW3 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
TriobpQ99KW3 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
TriobpQ99KW3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
TriobpQ99KW3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
TriobpQ99KW3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TriobpQ99KW3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TriobpQ99KW3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TriobpQ99KW3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TriobpQ99KW3 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TriobpQ99KW3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TriobpQ99KW3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TriobpQ99KW3 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
TriobpQ99KW3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TriobpQ99KW3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TriobpQ99KW3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TriobpQ99KW3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TriobpQ99KW3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TriobpQ99KW3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TriobpQ99KW3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms