Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU0

Vmp1, Vacuole membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmp1Q99KU0 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmp1Q99KU0 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmp1Q99KU0 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Vmp1Q99KU0 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Vmp1Q99KU0 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Vmp1Q99KU0 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmp1Q99KU0 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmp1Q99KU0 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmp1Q99KU0 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmp1Q99KU0 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmp1Q99KU0 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmp1Q99KU0 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmp1Q99KU0 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmp1Q99KU0 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmp1Q99KU0 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmp1Q99KU0 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmp1Q99KU0 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmp1Q99KU0 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmp1Q99KU0 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmp1Q99KU0 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmp1Q99KU0 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmp1Q99KU0 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmp1Q99KU0 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmp1Q99KU0 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmp1Q99KU0 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmp1Q99KU0 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmp1Q99KU0 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmp1Q99KU0 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmp1Q99KU0 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmp1Q99KU0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmp1Q99KU0 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmp1Q99KU0 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmp1Q99KU0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmp1Q99KU0 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmp1Q99KU0 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmp1Q99KU0 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmp1Q99KU0 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmp1Q99KU0 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmp1Q99KU0 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmp1Q99KU0 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmp1Q99KU0 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmp1Q99KU0 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmp1Q99KU0 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmp1Q99KU0 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmp1Q99KU0 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmp1Q99KU0 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmp1Q99KU0 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmp1Q99KU0 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmp1Q99KU0 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmp1Q99KU0 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmp1Q99KU0 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmp1Q99KU0 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmp1Q99KU0 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmp1Q99KU0 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmp1Q99KU0 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmp1Q99KU0 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmp1Q99KU0 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vmp1Q99KU0 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vmp1Q99KU0 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vmp1Q99KU0 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vmp1Q99KU0 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vmp1Q99KU0 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vmp1Q99KU0 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Vmp1Q99KU0 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vmp1Q99KU0 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vmp1Q99KU0 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vmp1Q99KU0 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vmp1Q99KU0 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vmp1Q99KU0 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Vmp1Q99KU0 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vmp1Q99KU0 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vmp1Q99KU0 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vmp1Q99KU0 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vmp1Q99KU0 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vmp1Q99KU0 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vmp1Q99KU0 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vmp1Q99KU0 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Vmp1Q99KU0 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vmp1Q99KU0 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmp1Q99KU0 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmp1Q99KU0 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmp1Q99KU0 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmp1Q99KU0 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmp1Q99KU0 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmp1Q99KU0 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmp1Q99KU0 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmp1Q99KU0 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmp1Q99KU0 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmp1Q99KU0 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmp1Q99KU0 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmp1Q99KU0 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmp1Q99KU0 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmp1Q99KU0 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmp1Q99KU0 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmp1Q99KU0 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmp1Q99KU0 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vmp1Q99KU0 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vmp1Q99KU0 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vmp1Q99KU0 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vmp1Q99KU0 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms