Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR7

Ppif, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase F, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpifQ99KR7 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PpifQ99KR7 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PpifQ99KR7 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PpifQ99KR7 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PpifQ99KR7 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PpifQ99KR7 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PpifQ99KR7 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PpifQ99KR7 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PpifQ99KR7 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PpifQ99KR7 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PpifQ99KR7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PpifQ99KR7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PpifQ99KR7 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PpifQ99KR7 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PpifQ99KR7 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PpifQ99KR7 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PpifQ99KR7 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PpifQ99KR7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PpifQ99KR7 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PpifQ99KR7 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PpifQ99KR7 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PpifQ99KR7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PpifQ99KR7 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PpifQ99KR7 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PpifQ99KR7 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PpifQ99KR7 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PpifQ99KR7 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PpifQ99KR7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PpifQ99KR7 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PpifQ99KR7 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PpifQ99KR7 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PpifQ99KR7 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PpifQ99KR7 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PpifQ99KR7 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PpifQ99KR7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PpifQ99KR7 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PpifQ99KR7 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PpifQ99KR7 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PpifQ99KR7 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PpifQ99KR7 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PpifQ99KR7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PpifQ99KR7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PpifQ99KR7 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PpifQ99KR7 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PpifQ99KR7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PpifQ99KR7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PpifQ99KR7 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PpifQ99KR7 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PpifQ99KR7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PpifQ99KR7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PpifQ99KR7 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PpifQ99KR7 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PpifQ99KR7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PpifQ99KR7 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PpifQ99KR7 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PpifQ99KR7 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PpifQ99KR7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PpifQ99KR7 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PpifQ99KR7 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PpifQ99KR7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PpifQ99KR7 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PpifQ99KR7 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PpifQ99KR7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PpifQ99KR7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PpifQ99KR7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PpifQ99KR7 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PpifQ99KR7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PpifQ99KR7 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PpifQ99KR7 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PpifQ99KR7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PpifQ99KR7 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PpifQ99KR7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PpifQ99KR7 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PpifQ99KR7 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PpifQ99KR7 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PpifQ99KR7 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PpifQ99KR7 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PpifQ99KR7 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PpifQ99KR7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PpifQ99KR7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PpifQ99KR7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PpifQ99KR7 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PpifQ99KR7 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PpifQ99KR7 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PpifQ99KR7 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PpifQ99KR7 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PpifQ99KR7 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PpifQ99KR7 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PpifQ99KR7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PpifQ99KR7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PpifQ99KR7 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PpifQ99KR7 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PpifQ99KR7 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PpifQ99KR7 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PpifQ99KR7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PpifQ99KR7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PpifQ99KR7 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PpifQ99KR7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PpifQ99KR7 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PpifQ99KR7 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.6 ms