Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT5

Krcc1, Lysine-rich coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krcc1Q99JT5 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krcc1Q99JT5 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krcc1Q99JT5 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krcc1Q99JT5 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krcc1Q99JT5 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krcc1Q99JT5 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krcc1Q99JT5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krcc1Q99JT5 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krcc1Q99JT5 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krcc1Q99JT5 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krcc1Q99JT5 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krcc1Q99JT5 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krcc1Q99JT5 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krcc1Q99JT5 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krcc1Q99JT5 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krcc1Q99JT5 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krcc1Q99JT5 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krcc1Q99JT5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Krcc1Q99JT5 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krcc1Q99JT5 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krcc1Q99JT5 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krcc1Q99JT5 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krcc1Q99JT5 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krcc1Q99JT5 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krcc1Q99JT5 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krcc1Q99JT5 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krcc1Q99JT5 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krcc1Q99JT5 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krcc1Q99JT5 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krcc1Q99JT5 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krcc1Q99JT5 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krcc1Q99JT5 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krcc1Q99JT5 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krcc1Q99JT5 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krcc1Q99JT5 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krcc1Q99JT5 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krcc1Q99JT5 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krcc1Q99JT5 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krcc1Q99JT5 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krcc1Q99JT5 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krcc1Q99JT5 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krcc1Q99JT5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krcc1Q99JT5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krcc1Q99JT5 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krcc1Q99JT5 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krcc1Q99JT5 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krcc1Q99JT5 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krcc1Q99JT5 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krcc1Q99JT5 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krcc1Q99JT5 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krcc1Q99JT5 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krcc1Q99JT5 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krcc1Q99JT5 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krcc1Q99JT5 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krcc1Q99JT5 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Krcc1Q99JT5 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krcc1Q99JT5 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krcc1Q99JT5 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krcc1Q99JT5 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krcc1Q99JT5 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krcc1Q99JT5 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krcc1Q99JT5 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krcc1Q99JT5 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krcc1Q99JT5 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krcc1Q99JT5 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krcc1Q99JT5 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krcc1Q99JT5 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krcc1Q99JT5 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Krcc1Q99JT5 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krcc1Q99JT5 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krcc1Q99JT5 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krcc1Q99JT5 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krcc1Q99JT5 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Krcc1Q99JT5 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krcc1Q99JT5 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krcc1Q99JT5 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krcc1Q99JT5 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krcc1Q99JT5 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krcc1Q99JT5 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krcc1Q99JT5 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krcc1Q99JT5 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krcc1Q99JT5 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krcc1Q99JT5 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krcc1Q99JT5 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krcc1Q99JT5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krcc1Q99JT5 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krcc1Q99JT5 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krcc1Q99JT5 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krcc1Q99JT5 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krcc1Q99JT5 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krcc1Q99JT5 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krcc1Q99JT5 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krcc1Q99JT5 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krcc1Q99JT5 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Krcc1Q99JT5 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krcc1Q99JT5 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krcc1Q99JT5 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krcc1Q99JT5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krcc1Q99JT5 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krcc1Q99JT5 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms