Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smim11aQ99J19 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smim11aQ99J19 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smim11aQ99J19 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smim11aQ99J19 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smim11aQ99J19 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smim11aQ99J19 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Smim11aQ99J19 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smim11aQ99J19 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smim11aQ99J19 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smim11aQ99J19 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smim11aQ99J19 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smim11aQ99J19 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smim11aQ99J19 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smim11aQ99J19 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smim11aQ99J19 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smim11aQ99J19 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Smim11aQ99J19 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smim11aQ99J19 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smim11aQ99J19 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smim11aQ99J19 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smim11aQ99J19 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smim11aQ99J19 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smim11aQ99J19 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smim11aQ99J19 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smim11aQ99J19 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smim11aQ99J19 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Smim11aQ99J19 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smim11aQ99J19 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smim11aQ99J19 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smim11aQ99J19 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smim11aQ99J19 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smim11aQ99J19 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smim11aQ99J19 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smim11aQ99J19 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smim11aQ99J19 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smim11aQ99J19 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smim11aQ99J19 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smim11aQ99J19 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smim11aQ99J19 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smim11aQ99J19 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smim11aQ99J19 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smim11aQ99J19 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smim11aQ99J19 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Smim11aQ99J19 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smim11aQ99J19 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smim11aQ99J19 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smim11aQ99J19 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Smim11aQ99J19 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smim11aQ99J19 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smim11aQ99J19 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smim11aQ99J19 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smim11aQ99J19 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Smim11aQ99J19 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smim11aQ99J19 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smim11aQ99J19 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smim11aQ99J19 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smim11aQ99J19 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smim11aQ99J19 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smim11aQ99J19 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smim11aQ99J19 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smim11aQ99J19 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smim11aQ99J19 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Smim11aQ99J19 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Smim11aQ99J19 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smim11aQ99J19 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smim11aQ99J19 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smim11aQ99J19 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smim11aQ99J19 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smim11aQ99J19 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smim11aQ99J19 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smim11aQ99J19 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smim11aQ99J19 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smim11aQ99J19 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smim11aQ99J19 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smim11aQ99J19 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smim11aQ99J19 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smim11aQ99J19 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smim11aQ99J19 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smim11aQ99J19 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smim11aQ99J19 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smim11aQ99J19 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smim11aQ99J19 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smim11aQ99J19 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smim11aQ99J19 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smim11aQ99J19 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smim11aQ99J19 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Smim11aQ99J19 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smim11aQ99J19 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Smim11aQ99J19 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smim11aQ99J19 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smim11aQ99J19 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smim11aQ99J19 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smim11aQ99J19 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smim11aQ99J19 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smim11aQ99J19 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smim11aQ99J19 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smim11aQ99J19 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Smim11aQ99J19 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smim11aQ99J19 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms