Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn16Q925N4 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn16Q925N4 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn16Q925N4 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn16Q925N4 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn16Q925N4 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn16Q925N4 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn16Q925N4 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn16Q925N4 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn16Q925N4 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn16Q925N4 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn16Q925N4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn16Q925N4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn16Q925N4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn16Q925N4 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn16Q925N4 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn16Q925N4 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn16Q925N4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn16Q925N4 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn16Q925N4 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn16Q925N4 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn16Q925N4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn16Q925N4 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn16Q925N4 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn16Q925N4 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn16Q925N4 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn16Q925N4 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn16Q925N4 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn16Q925N4 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn16Q925N4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn16Q925N4 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn16Q925N4 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn16Q925N4 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn16Q925N4 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn16Q925N4 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn16Q925N4 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn16Q925N4 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn16Q925N4 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn16Q925N4 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn16Q925N4 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn16Q925N4 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn16Q925N4 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn16Q925N4 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn16Q925N4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn16Q925N4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn16Q925N4 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn16Q925N4 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn16Q925N4 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn16Q925N4 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn16Q925N4 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn16Q925N4 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn16Q925N4 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn16Q925N4 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn16Q925N4 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn16Q925N4 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn16Q925N4 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn16Q925N4 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn16Q925N4 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn16Q925N4 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn16Q925N4 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn16Q925N4 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn16Q925N4 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn16Q925N4 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn16Q925N4 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn16Q925N4 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn16Q925N4 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn16Q925N4 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn16Q925N4 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn16Q925N4 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn16Q925N4 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn16Q925N4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn16Q925N4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn16Q925N4 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn16Q925N4 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn16Q925N4 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn16Q925N4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn16Q925N4 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn16Q925N4 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn16Q925N4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn16Q925N4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn16Q925N4 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn16Q925N4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn16Q925N4 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn16Q925N4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn16Q925N4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn16Q925N4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn16Q925N4 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn16Q925N4 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn16Q925N4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn16Q925N4 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn16Q925N4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn16Q925N4 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn16Q925N4 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn16Q925N4 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn16Q925N4 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn16Q925N4 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn16Q925N4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn16Q925N4 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn16Q925N4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn16Q925N4 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms