Protein–RNA interactions for Protein: Q923T7

Trim7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim7Q923T7 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim7Q923T7 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim7Q923T7 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim7Q923T7 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim7Q923T7 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim7Q923T7 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim7Q923T7 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim7Q923T7 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim7Q923T7 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim7Q923T7 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim7Q923T7 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim7Q923T7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim7Q923T7 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim7Q923T7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim7Q923T7 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim7Q923T7 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim7Q923T7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim7Q923T7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim7Q923T7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim7Q923T7 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim7Q923T7 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim7Q923T7 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim7Q923T7 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim7Q923T7 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trim7Q923T7 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trim7Q923T7 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trim7Q923T7 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Trim7Q923T7 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trim7Q923T7 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trim7Q923T7 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trim7Q923T7 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trim7Q923T7 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trim7Q923T7 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trim7Q923T7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trim7Q923T7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim7Q923T7 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim7Q923T7 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim7Q923T7 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim7Q923T7 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim7Q923T7 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim7Q923T7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim7Q923T7 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim7Q923T7 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim7Q923T7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim7Q923T7 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim7Q923T7 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim7Q923T7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim7Q923T7 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim7Q923T7 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim7Q923T7 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim7Q923T7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim7Q923T7 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim7Q923T7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim7Q923T7 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim7Q923T7 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim7Q923T7 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim7Q923T7 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim7Q923T7 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim7Q923T7 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim7Q923T7 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim7Q923T7 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim7Q923T7 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim7Q923T7 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim7Q923T7 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim7Q923T7 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim7Q923T7 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim7Q923T7 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim7Q923T7 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim7Q923T7 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim7Q923T7 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim7Q923T7 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim7Q923T7 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim7Q923T7 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim7Q923T7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim7Q923T7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim7Q923T7 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim7Q923T7 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim7Q923T7 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim7Q923T7 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim7Q923T7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim7Q923T7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim7Q923T7 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim7Q923T7 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim7Q923T7 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim7Q923T7 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim7Q923T7 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim7Q923T7 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim7Q923T7 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim7Q923T7 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim7Q923T7 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim7Q923T7 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim7Q923T7 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim7Q923T7 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim7Q923T7 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim7Q923T7 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim7Q923T7 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim7Q923T7 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim7Q923T7 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim7Q923T7 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim7Q923T7 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms