Protein–RNA interactions for Protein: Q922Q2

Riok1, Serine/threonine-protein kinase RIO1, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok1Q922Q2 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Riok1Q922Q2 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Riok1Q922Q2 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Riok1Q922Q2 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Riok1Q922Q2 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Riok1Q922Q2 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Riok1Q922Q2 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Riok1Q922Q2 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Riok1Q922Q2 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Riok1Q922Q2 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Riok1Q922Q2 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Riok1Q922Q2 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Riok1Q922Q2 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Riok1Q922Q2 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Riok1Q922Q2 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Riok1Q922Q2 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Riok1Q922Q2 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Riok1Q922Q2 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Riok1Q922Q2 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Riok1Q922Q2 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Riok1Q922Q2 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Riok1Q922Q2 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Riok1Q922Q2 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Riok1Q922Q2 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Riok1Q922Q2 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Riok1Q922Q2 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Riok1Q922Q2 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Riok1Q922Q2 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Riok1Q922Q2 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Riok1Q922Q2 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Riok1Q922Q2 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Riok1Q922Q2 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Riok1Q922Q2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Riok1Q922Q2 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Riok1Q922Q2 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Riok1Q922Q2 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Riok1Q922Q2 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Riok1Q922Q2 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Riok1Q922Q2 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Riok1Q922Q2 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Riok1Q922Q2 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Riok1Q922Q2 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Riok1Q922Q2 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Riok1Q922Q2 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Riok1Q922Q2 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Riok1Q922Q2 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Riok1Q922Q2 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Riok1Q922Q2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Riok1Q922Q2 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Riok1Q922Q2 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Riok1Q922Q2 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Riok1Q922Q2 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Riok1Q922Q2 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Riok1Q922Q2 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Riok1Q922Q2 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Riok1Q922Q2 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Riok1Q922Q2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Riok1Q922Q2 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Riok1Q922Q2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Riok1Q922Q2 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Riok1Q922Q2 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Riok1Q922Q2 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Riok1Q922Q2 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Riok1Q922Q2 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Riok1Q922Q2 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Riok1Q922Q2 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Riok1Q922Q2 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Riok1Q922Q2 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Riok1Q922Q2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Riok1Q922Q2 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Riok1Q922Q2 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Riok1Q922Q2 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Riok1Q922Q2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Riok1Q922Q2 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Riok1Q922Q2 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Riok1Q922Q2 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Riok1Q922Q2 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Riok1Q922Q2 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Riok1Q922Q2 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Riok1Q922Q2 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Riok1Q922Q2 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Riok1Q922Q2 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Riok1Q922Q2 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Riok1Q922Q2 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Riok1Q922Q2 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Riok1Q922Q2 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Riok1Q922Q2 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Riok1Q922Q2 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Riok1Q922Q2 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Riok1Q922Q2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Riok1Q922Q2 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Riok1Q922Q2 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Riok1Q922Q2 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Riok1Q922Q2 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Riok1Q922Q2 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Riok1Q922Q2 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Riok1Q922Q2 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Riok1Q922Q2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Riok1Q922Q2 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Riok1Q922Q2 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms