Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ1

Pde6c, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', mousemouse

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Length 861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6cQ91ZQ1 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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Pde6cQ91ZQ1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pde6cQ91ZQ1 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pde6cQ91ZQ1 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pde6cQ91ZQ1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pde6cQ91ZQ1 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pde6cQ91ZQ1 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pde6cQ91ZQ1 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pde6cQ91ZQ1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pde6cQ91ZQ1 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pde6cQ91ZQ1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pde6cQ91ZQ1 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Pde6cQ91ZQ1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pde6cQ91ZQ1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pde6cQ91ZQ1 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pde6cQ91ZQ1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pde6cQ91ZQ1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pde6cQ91ZQ1 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
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Pde6cQ91ZQ1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pde6cQ91ZQ1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pde6cQ91ZQ1 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Pde6cQ91ZQ1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pde6cQ91ZQ1 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pde6cQ91ZQ1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pde6cQ91ZQ1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pde6cQ91ZQ1 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pde6cQ91ZQ1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pde6cQ91ZQ1 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pde6cQ91ZQ1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pde6cQ91ZQ1 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pde6cQ91ZQ1 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pde6cQ91ZQ1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pde6cQ91ZQ1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pde6cQ91ZQ1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pde6cQ91ZQ1 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pde6cQ91ZQ1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pde6cQ91ZQ1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pde6cQ91ZQ1 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pde6cQ91ZQ1 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pde6cQ91ZQ1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pde6cQ91ZQ1 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pde6cQ91ZQ1 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pde6cQ91ZQ1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pde6cQ91ZQ1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pde6cQ91ZQ1 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pde6cQ91ZQ1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pde6cQ91ZQ1 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pde6cQ91ZQ1 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pde6cQ91ZQ1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pde6cQ91ZQ1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Pde6cQ91ZQ1 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pde6cQ91ZQ1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pde6cQ91ZQ1 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pde6cQ91ZQ1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pde6cQ91ZQ1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pde6cQ91ZQ1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pde6cQ91ZQ1 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pde6cQ91ZQ1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pde6cQ91ZQ1 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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Pde6cQ91ZQ1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pde6cQ91ZQ1 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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Pde6cQ91ZQ1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pde6cQ91ZQ1 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pde6cQ91ZQ1 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
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Pde6cQ91ZQ1 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Pde6cQ91ZQ1 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pde6cQ91ZQ1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pde6cQ91ZQ1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pde6cQ91ZQ1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pde6cQ91ZQ1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pde6cQ91ZQ1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pde6cQ91ZQ1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pde6cQ91ZQ1 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
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