Protein–RNA interactions for Protein: Q91YD4

Trpm2, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm2Q91YD4 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Trpm2Q91YD4 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Trpm2Q91YD4 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Trpm2Q91YD4 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Trpm2Q91YD4 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Trpm2Q91YD4 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Trpm2Q91YD4 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Trpm2Q91YD4 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Trpm2Q91YD4 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Trpm2Q91YD4 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Trpm2Q91YD4 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Trpm2Q91YD4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Trpm2Q91YD4 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Trpm2Q91YD4 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Trpm2Q91YD4 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Trpm2Q91YD4 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Trpm2Q91YD4 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Trpm2Q91YD4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Trpm2Q91YD4 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Trpm2Q91YD4 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Trpm2Q91YD4 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Trpm2Q91YD4 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Trpm2Q91YD4 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Trpm2Q91YD4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Trpm2Q91YD4 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Trpm2Q91YD4 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Trpm2Q91YD4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Trpm2Q91YD4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Trpm2Q91YD4 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Trpm2Q91YD4 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Trpm2Q91YD4 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Trpm2Q91YD4 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Trpm2Q91YD4 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Trpm2Q91YD4 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Trpm2Q91YD4 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Trpm2Q91YD4 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Trpm2Q91YD4 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Trpm2Q91YD4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Trpm2Q91YD4 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Trpm2Q91YD4 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Trpm2Q91YD4 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Trpm2Q91YD4 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
Trpm2Q91YD4 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC27.26■■□□□ 1.96
Trpm2Q91YD4 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Trpm2Q91YD4 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Trpm2Q91YD4 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Trpm2Q91YD4 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Trpm2Q91YD4 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Trpm2Q91YD4 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Trpm2Q91YD4 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Trpm2Q91YD4 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Trpm2Q91YD4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Trpm2Q91YD4 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Trpm2Q91YD4 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Trpm2Q91YD4 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Trpm2Q91YD4 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Trpm2Q91YD4 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Trpm2Q91YD4 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Trpm2Q91YD4 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Trpm2Q91YD4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Trpm2Q91YD4 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Trpm2Q91YD4 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Trpm2Q91YD4 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Trpm2Q91YD4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Trpm2Q91YD4 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Trpm2Q91YD4 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Trpm2Q91YD4 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Trpm2Q91YD4 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Trpm2Q91YD4 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Trpm2Q91YD4 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Trpm2Q91YD4 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Trpm2Q91YD4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Trpm2Q91YD4 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Trpm2Q91YD4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Trpm2Q91YD4 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Trpm2Q91YD4 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Trpm2Q91YD4 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Trpm2Q91YD4 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Trpm2Q91YD4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Trpm2Q91YD4 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Trpm2Q91YD4 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Trpm2Q91YD4 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Trpm2Q91YD4 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Trpm2Q91YD4 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Trpm2Q91YD4 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Trpm2Q91YD4 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Trpm2Q91YD4 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Trpm2Q91YD4 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Trpm2Q91YD4 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Trpm2Q91YD4 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Trpm2Q91YD4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Trpm2Q91YD4 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Trpm2Q91YD4 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Trpm2Q91YD4 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Trpm2Q91YD4 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Trpm2Q91YD4 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Trpm2Q91YD4 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Trpm2Q91YD4 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Trpm2Q91YD4 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Trpm2Q91YD4 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms