Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDJ3

Hdlbp, Vigilin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HdlbpQ8VDJ3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HdlbpQ8VDJ3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HdlbpQ8VDJ3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HdlbpQ8VDJ3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HdlbpQ8VDJ3 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HdlbpQ8VDJ3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HdlbpQ8VDJ3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HdlbpQ8VDJ3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HdlbpQ8VDJ3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HdlbpQ8VDJ3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HdlbpQ8VDJ3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HdlbpQ8VDJ3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HdlbpQ8VDJ3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HdlbpQ8VDJ3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HdlbpQ8VDJ3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HdlbpQ8VDJ3 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HdlbpQ8VDJ3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HdlbpQ8VDJ3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HdlbpQ8VDJ3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HdlbpQ8VDJ3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HdlbpQ8VDJ3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HdlbpQ8VDJ3 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HdlbpQ8VDJ3 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HdlbpQ8VDJ3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HdlbpQ8VDJ3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HdlbpQ8VDJ3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HdlbpQ8VDJ3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HdlbpQ8VDJ3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HdlbpQ8VDJ3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HdlbpQ8VDJ3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HdlbpQ8VDJ3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HdlbpQ8VDJ3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HdlbpQ8VDJ3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HdlbpQ8VDJ3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HdlbpQ8VDJ3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HdlbpQ8VDJ3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HdlbpQ8VDJ3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HdlbpQ8VDJ3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HdlbpQ8VDJ3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HdlbpQ8VDJ3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HdlbpQ8VDJ3 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HdlbpQ8VDJ3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HdlbpQ8VDJ3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HdlbpQ8VDJ3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HdlbpQ8VDJ3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HdlbpQ8VDJ3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HdlbpQ8VDJ3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HdlbpQ8VDJ3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HdlbpQ8VDJ3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HdlbpQ8VDJ3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HdlbpQ8VDJ3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HdlbpQ8VDJ3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HdlbpQ8VDJ3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HdlbpQ8VDJ3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HdlbpQ8VDJ3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HdlbpQ8VDJ3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HdlbpQ8VDJ3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
HdlbpQ8VDJ3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HdlbpQ8VDJ3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HdlbpQ8VDJ3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HdlbpQ8VDJ3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HdlbpQ8VDJ3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HdlbpQ8VDJ3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HdlbpQ8VDJ3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HdlbpQ8VDJ3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HdlbpQ8VDJ3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HdlbpQ8VDJ3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HdlbpQ8VDJ3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HdlbpQ8VDJ3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HdlbpQ8VDJ3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HdlbpQ8VDJ3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HdlbpQ8VDJ3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HdlbpQ8VDJ3 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HdlbpQ8VDJ3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HdlbpQ8VDJ3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HdlbpQ8VDJ3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HdlbpQ8VDJ3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HdlbpQ8VDJ3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HdlbpQ8VDJ3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HdlbpQ8VDJ3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HdlbpQ8VDJ3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HdlbpQ8VDJ3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HdlbpQ8VDJ3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HdlbpQ8VDJ3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HdlbpQ8VDJ3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HdlbpQ8VDJ3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HdlbpQ8VDJ3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HdlbpQ8VDJ3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HdlbpQ8VDJ3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HdlbpQ8VDJ3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HdlbpQ8VDJ3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HdlbpQ8VDJ3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HdlbpQ8VDJ3 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HdlbpQ8VDJ3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HdlbpQ8VDJ3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HdlbpQ8VDJ3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HdlbpQ8VDJ3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HdlbpQ8VDJ3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HdlbpQ8VDJ3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HdlbpQ8VDJ3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms