Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDG3

Parn, Poly(A)-specific ribonuclease PARN, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParnQ8VDG3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ParnQ8VDG3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ParnQ8VDG3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ParnQ8VDG3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ParnQ8VDG3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ParnQ8VDG3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ParnQ8VDG3 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ParnQ8VDG3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ParnQ8VDG3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ParnQ8VDG3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ParnQ8VDG3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ParnQ8VDG3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ParnQ8VDG3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ParnQ8VDG3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ParnQ8VDG3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ParnQ8VDG3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ParnQ8VDG3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ParnQ8VDG3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ParnQ8VDG3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ParnQ8VDG3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ParnQ8VDG3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ParnQ8VDG3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ParnQ8VDG3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ParnQ8VDG3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ParnQ8VDG3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ParnQ8VDG3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ParnQ8VDG3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ParnQ8VDG3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ParnQ8VDG3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ParnQ8VDG3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ParnQ8VDG3 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ParnQ8VDG3 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ParnQ8VDG3 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ParnQ8VDG3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ParnQ8VDG3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ParnQ8VDG3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ParnQ8VDG3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ParnQ8VDG3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ParnQ8VDG3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ParnQ8VDG3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ParnQ8VDG3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ParnQ8VDG3 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ParnQ8VDG3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ParnQ8VDG3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ParnQ8VDG3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ParnQ8VDG3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ParnQ8VDG3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ParnQ8VDG3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ParnQ8VDG3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ParnQ8VDG3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ParnQ8VDG3 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ParnQ8VDG3 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ParnQ8VDG3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ParnQ8VDG3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ParnQ8VDG3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ParnQ8VDG3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ParnQ8VDG3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ParnQ8VDG3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ParnQ8VDG3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ParnQ8VDG3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ParnQ8VDG3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ParnQ8VDG3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ParnQ8VDG3 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ParnQ8VDG3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ParnQ8VDG3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ParnQ8VDG3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ParnQ8VDG3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ParnQ8VDG3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ParnQ8VDG3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ParnQ8VDG3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ParnQ8VDG3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ParnQ8VDG3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ParnQ8VDG3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ParnQ8VDG3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ParnQ8VDG3 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ParnQ8VDG3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ParnQ8VDG3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ParnQ8VDG3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ParnQ8VDG3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ParnQ8VDG3 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ParnQ8VDG3 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ParnQ8VDG3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ParnQ8VDG3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ParnQ8VDG3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ParnQ8VDG3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ParnQ8VDG3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ParnQ8VDG3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ParnQ8VDG3 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ParnQ8VDG3 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ParnQ8VDG3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ParnQ8VDG3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ParnQ8VDG3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ParnQ8VDG3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ParnQ8VDG3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ParnQ8VDG3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ParnQ8VDG3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ParnQ8VDG3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ParnQ8VDG3 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ParnQ8VDG3 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ParnQ8VDG3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms