Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ubxn4Q8VCH8 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ubxn4Q8VCH8 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ubxn4Q8VCH8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ubxn4Q8VCH8 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ubxn4Q8VCH8 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ubxn4Q8VCH8 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ubxn4Q8VCH8 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ubxn4Q8VCH8 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ubxn4Q8VCH8 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ubxn4Q8VCH8 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ubxn4Q8VCH8 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ubxn4Q8VCH8 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ubxn4Q8VCH8 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ubxn4Q8VCH8 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Ubxn4Q8VCH8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ubxn4Q8VCH8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ubxn4Q8VCH8 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ubxn4Q8VCH8 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ubxn4Q8VCH8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ubxn4Q8VCH8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ubxn4Q8VCH8 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ubxn4Q8VCH8 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ubxn4Q8VCH8 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ubxn4Q8VCH8 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ubxn4Q8VCH8 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ubxn4Q8VCH8 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ubxn4Q8VCH8 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ubxn4Q8VCH8 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ubxn4Q8VCH8 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ubxn4Q8VCH8 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ubxn4Q8VCH8 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ubxn4Q8VCH8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ubxn4Q8VCH8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ubxn4Q8VCH8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Ubxn4Q8VCH8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ubxn4Q8VCH8 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ubxn4Q8VCH8 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ubxn4Q8VCH8 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ubxn4Q8VCH8 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ubxn4Q8VCH8 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ubxn4Q8VCH8 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ubxn4Q8VCH8 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ubxn4Q8VCH8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ubxn4Q8VCH8 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ubxn4Q8VCH8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ubxn4Q8VCH8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ubxn4Q8VCH8 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ubxn4Q8VCH8 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ubxn4Q8VCH8 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ubxn4Q8VCH8 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ubxn4Q8VCH8 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ubxn4Q8VCH8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ubxn4Q8VCH8 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ubxn4Q8VCH8 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ubxn4Q8VCH8 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ubxn4Q8VCH8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ubxn4Q8VCH8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ubxn4Q8VCH8 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ubxn4Q8VCH8 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ubxn4Q8VCH8 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ubxn4Q8VCH8 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ubxn4Q8VCH8 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ubxn4Q8VCH8 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ubxn4Q8VCH8 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Ubxn4Q8VCH8 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ubxn4Q8VCH8 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ubxn4Q8VCH8 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ubxn4Q8VCH8 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ubxn4Q8VCH8 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ubxn4Q8VCH8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ubxn4Q8VCH8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ubxn4Q8VCH8 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ubxn4Q8VCH8 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ubxn4Q8VCH8 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ubxn4Q8VCH8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ubxn4Q8VCH8 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ubxn4Q8VCH8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ubxn4Q8VCH8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ubxn4Q8VCH8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ubxn4Q8VCH8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ubxn4Q8VCH8 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ubxn4Q8VCH8 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ubxn4Q8VCH8 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ubxn4Q8VCH8 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ubxn4Q8VCH8 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ubxn4Q8VCH8 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ubxn4Q8VCH8 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ubxn4Q8VCH8 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ubxn4Q8VCH8 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ubxn4Q8VCH8 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ubxn4Q8VCH8 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ubxn4Q8VCH8 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ubxn4Q8VCH8 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ubxn4Q8VCH8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ubxn4Q8VCH8 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ubxn4Q8VCH8 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ubxn4Q8VCH8 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ubxn4Q8VCH8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ubxn4Q8VCH8 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms