Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4R6

Nup35, Nucleoporin NUP53, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup35Q8R4R6 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup35Q8R4R6 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup35Q8R4R6 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup35Q8R4R6 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup35Q8R4R6 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup35Q8R4R6 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup35Q8R4R6 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup35Q8R4R6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup35Q8R4R6 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup35Q8R4R6 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup35Q8R4R6 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup35Q8R4R6 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup35Q8R4R6 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup35Q8R4R6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup35Q8R4R6 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup35Q8R4R6 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup35Q8R4R6 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup35Q8R4R6 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup35Q8R4R6 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup35Q8R4R6 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup35Q8R4R6 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup35Q8R4R6 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup35Q8R4R6 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup35Q8R4R6 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup35Q8R4R6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup35Q8R4R6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup35Q8R4R6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup35Q8R4R6 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup35Q8R4R6 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup35Q8R4R6 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup35Q8R4R6 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nup35Q8R4R6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nup35Q8R4R6 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nup35Q8R4R6 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nup35Q8R4R6 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nup35Q8R4R6 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nup35Q8R4R6 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nup35Q8R4R6 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nup35Q8R4R6 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nup35Q8R4R6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nup35Q8R4R6 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nup35Q8R4R6 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nup35Q8R4R6 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nup35Q8R4R6 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nup35Q8R4R6 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nup35Q8R4R6 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nup35Q8R4R6 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nup35Q8R4R6 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nup35Q8R4R6 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup35Q8R4R6 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup35Q8R4R6 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup35Q8R4R6 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup35Q8R4R6 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup35Q8R4R6 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup35Q8R4R6 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup35Q8R4R6 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup35Q8R4R6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup35Q8R4R6 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup35Q8R4R6 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup35Q8R4R6 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup35Q8R4R6 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup35Q8R4R6 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup35Q8R4R6 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup35Q8R4R6 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup35Q8R4R6 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup35Q8R4R6 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup35Q8R4R6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup35Q8R4R6 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup35Q8R4R6 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup35Q8R4R6 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup35Q8R4R6 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup35Q8R4R6 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup35Q8R4R6 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup35Q8R4R6 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup35Q8R4R6 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup35Q8R4R6 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup35Q8R4R6 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup35Q8R4R6 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup35Q8R4R6 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup35Q8R4R6 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup35Q8R4R6 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup35Q8R4R6 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup35Q8R4R6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup35Q8R4R6 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup35Q8R4R6 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup35Q8R4R6 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup35Q8R4R6 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup35Q8R4R6 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup35Q8R4R6 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup35Q8R4R6 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup35Q8R4R6 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup35Q8R4R6 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup35Q8R4R6 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup35Q8R4R6 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup35Q8R4R6 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nup35Q8R4R6 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nup35Q8R4R6 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nup35Q8R4R6 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nup35Q8R4R6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nup35Q8R4R6 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms