Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc12Q8R344 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc12Q8R344 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc12Q8R344 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc12Q8R344 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc12Q8R344 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc12Q8R344 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc12Q8R344 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc12Q8R344 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc12Q8R344 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc12Q8R344 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc12Q8R344 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc12Q8R344 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc12Q8R344 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc12Q8R344 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc12Q8R344 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc12Q8R344 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc12Q8R344 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc12Q8R344 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc12Q8R344 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc12Q8R344 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc12Q8R344 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc12Q8R344 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc12Q8R344 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc12Q8R344 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc12Q8R344 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc12Q8R344 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc12Q8R344 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc12Q8R344 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccdc12Q8R344 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccdc12Q8R344 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc12Q8R344 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc12Q8R344 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc12Q8R344 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc12Q8R344 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc12Q8R344 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc12Q8R344 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc12Q8R344 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc12Q8R344 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc12Q8R344 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc12Q8R344 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc12Q8R344 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc12Q8R344 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc12Q8R344 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc12Q8R344 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc12Q8R344 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc12Q8R344 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc12Q8R344 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc12Q8R344 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc12Q8R344 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc12Q8R344 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc12Q8R344 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc12Q8R344 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc12Q8R344 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc12Q8R344 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc12Q8R344 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc12Q8R344 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc12Q8R344 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc12Q8R344 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc12Q8R344 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc12Q8R344 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc12Q8R344 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc12Q8R344 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc12Q8R344 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc12Q8R344 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc12Q8R344 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc12Q8R344 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc12Q8R344 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc12Q8R344 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc12Q8R344 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc12Q8R344 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc12Q8R344 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc12Q8R344 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc12Q8R344 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc12Q8R344 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc12Q8R344 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc12Q8R344 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc12Q8R344 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc12Q8R344 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc12Q8R344 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc12Q8R344 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc12Q8R344 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc12Q8R344 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc12Q8R344 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc12Q8R344 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc12Q8R344 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc12Q8R344 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc12Q8R344 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc12Q8R344 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc12Q8R344 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc12Q8R344 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc12Q8R344 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc12Q8R344 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc12Q8R344 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc12Q8R344 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc12Q8R344 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc12Q8R344 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc12Q8R344 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc12Q8R344 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc12Q8R344 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms