Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MyripQ8K3I4 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MyripQ8K3I4 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MyripQ8K3I4 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MyripQ8K3I4 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MyripQ8K3I4 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MyripQ8K3I4 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MyripQ8K3I4 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MyripQ8K3I4 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MyripQ8K3I4 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MyripQ8K3I4 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MyripQ8K3I4 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MyripQ8K3I4 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MyripQ8K3I4 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MyripQ8K3I4 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MyripQ8K3I4 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MyripQ8K3I4 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MyripQ8K3I4 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MyripQ8K3I4 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MyripQ8K3I4 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MyripQ8K3I4 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MyripQ8K3I4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MyripQ8K3I4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MyripQ8K3I4 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MyripQ8K3I4 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MyripQ8K3I4 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MyripQ8K3I4 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MyripQ8K3I4 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MyripQ8K3I4 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MyripQ8K3I4 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MyripQ8K3I4 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MyripQ8K3I4 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MyripQ8K3I4 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MyripQ8K3I4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MyripQ8K3I4 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MyripQ8K3I4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MyripQ8K3I4 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MyripQ8K3I4 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MyripQ8K3I4 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MyripQ8K3I4 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MyripQ8K3I4 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MyripQ8K3I4 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MyripQ8K3I4 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MyripQ8K3I4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MyripQ8K3I4 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
MyripQ8K3I4 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MyripQ8K3I4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MyripQ8K3I4 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MyripQ8K3I4 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MyripQ8K3I4 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
MyripQ8K3I4 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MyripQ8K3I4 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MyripQ8K3I4 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MyripQ8K3I4 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MyripQ8K3I4 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MyripQ8K3I4 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MyripQ8K3I4 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MyripQ8K3I4 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MyripQ8K3I4 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MyripQ8K3I4 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MyripQ8K3I4 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
MyripQ8K3I4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MyripQ8K3I4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MyripQ8K3I4 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MyripQ8K3I4 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MyripQ8K3I4 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MyripQ8K3I4 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MyripQ8K3I4 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MyripQ8K3I4 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MyripQ8K3I4 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MyripQ8K3I4 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MyripQ8K3I4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MyripQ8K3I4 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MyripQ8K3I4 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MyripQ8K3I4 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
MyripQ8K3I4 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
MyripQ8K3I4 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MyripQ8K3I4 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MyripQ8K3I4 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MyripQ8K3I4 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MyripQ8K3I4 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MyripQ8K3I4 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MyripQ8K3I4 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MyripQ8K3I4 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MyripQ8K3I4 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MyripQ8K3I4 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MyripQ8K3I4 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MyripQ8K3I4 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MyripQ8K3I4 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MyripQ8K3I4 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MyripQ8K3I4 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MyripQ8K3I4 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MyripQ8K3I4 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
MyripQ8K3I4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MyripQ8K3I4 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MyripQ8K3I4 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MyripQ8K3I4 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MyripQ8K3I4 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MyripQ8K3I4 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MyripQ8K3I4 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms