Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Q9

Shtn1, Shootin-1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shtn1Q8K2Q9 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Shtn1Q8K2Q9 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Shtn1Q8K2Q9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Shtn1Q8K2Q9 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Shtn1Q8K2Q9 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Shtn1Q8K2Q9 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Shtn1Q8K2Q9 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Shtn1Q8K2Q9 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Shtn1Q8K2Q9 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Shtn1Q8K2Q9 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Shtn1Q8K2Q9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Shtn1Q8K2Q9 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Shtn1Q8K2Q9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Shtn1Q8K2Q9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Shtn1Q8K2Q9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Shtn1Q8K2Q9 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Shtn1Q8K2Q9 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Shtn1Q8K2Q9 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Shtn1Q8K2Q9 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Shtn1Q8K2Q9 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Shtn1Q8K2Q9 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Shtn1Q8K2Q9 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Shtn1Q8K2Q9 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Shtn1Q8K2Q9 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Shtn1Q8K2Q9 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Shtn1Q8K2Q9 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Shtn1Q8K2Q9 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Shtn1Q8K2Q9 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Shtn1Q8K2Q9 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Shtn1Q8K2Q9 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Shtn1Q8K2Q9 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Shtn1Q8K2Q9 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Shtn1Q8K2Q9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Shtn1Q8K2Q9 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Shtn1Q8K2Q9 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Shtn1Q8K2Q9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Shtn1Q8K2Q9 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Shtn1Q8K2Q9 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Shtn1Q8K2Q9 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Shtn1Q8K2Q9 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Shtn1Q8K2Q9 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Shtn1Q8K2Q9 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Shtn1Q8K2Q9 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Shtn1Q8K2Q9 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Shtn1Q8K2Q9 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Shtn1Q8K2Q9 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Shtn1Q8K2Q9 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Shtn1Q8K2Q9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Shtn1Q8K2Q9 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Shtn1Q8K2Q9 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Shtn1Q8K2Q9 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Shtn1Q8K2Q9 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Shtn1Q8K2Q9 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Shtn1Q8K2Q9 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Shtn1Q8K2Q9 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Shtn1Q8K2Q9 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Shtn1Q8K2Q9 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Shtn1Q8K2Q9 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Shtn1Q8K2Q9 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Shtn1Q8K2Q9 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Shtn1Q8K2Q9 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Shtn1Q8K2Q9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Shtn1Q8K2Q9 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Shtn1Q8K2Q9 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Shtn1Q8K2Q9 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Shtn1Q8K2Q9 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Shtn1Q8K2Q9 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Shtn1Q8K2Q9 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Shtn1Q8K2Q9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Shtn1Q8K2Q9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Shtn1Q8K2Q9 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Shtn1Q8K2Q9 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Shtn1Q8K2Q9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Shtn1Q8K2Q9 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Shtn1Q8K2Q9 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Shtn1Q8K2Q9 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Shtn1Q8K2Q9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Shtn1Q8K2Q9 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Shtn1Q8K2Q9 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Shtn1Q8K2Q9 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Shtn1Q8K2Q9 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Shtn1Q8K2Q9 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Shtn1Q8K2Q9 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Shtn1Q8K2Q9 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Shtn1Q8K2Q9 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Shtn1Q8K2Q9 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Shtn1Q8K2Q9 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Shtn1Q8K2Q9 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Shtn1Q8K2Q9 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Shtn1Q8K2Q9 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Shtn1Q8K2Q9 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Shtn1Q8K2Q9 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Shtn1Q8K2Q9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Shtn1Q8K2Q9 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Shtn1Q8K2Q9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Shtn1Q8K2Q9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Shtn1Q8K2Q9 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Shtn1Q8K2Q9 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Shtn1Q8K2Q9 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Shtn1Q8K2Q9 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms