Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Brd3Q8K2F0 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Brd3Q8K2F0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Brd3Q8K2F0 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Brd3Q8K2F0 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Brd3Q8K2F0 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Brd3Q8K2F0 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Brd3Q8K2F0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Brd3Q8K2F0 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Brd3Q8K2F0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Brd3Q8K2F0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Brd3Q8K2F0 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Brd3Q8K2F0 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Brd3Q8K2F0 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Brd3Q8K2F0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Brd3Q8K2F0 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Brd3Q8K2F0 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Brd3Q8K2F0 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Brd3Q8K2F0 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Brd3Q8K2F0 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Brd3Q8K2F0 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Brd3Q8K2F0 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Brd3Q8K2F0 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Brd3Q8K2F0 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Brd3Q8K2F0 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Brd3Q8K2F0 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Brd3Q8K2F0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Brd3Q8K2F0 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Brd3Q8K2F0 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Brd3Q8K2F0 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Brd3Q8K2F0 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Brd3Q8K2F0 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Brd3Q8K2F0 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Brd3Q8K2F0 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Brd3Q8K2F0 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Brd3Q8K2F0 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Brd3Q8K2F0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Brd3Q8K2F0 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Brd3Q8K2F0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Brd3Q8K2F0 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Brd3Q8K2F0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Brd3Q8K2F0 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Brd3Q8K2F0 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Brd3Q8K2F0 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Brd3Q8K2F0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Brd3Q8K2F0 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Brd3Q8K2F0 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Brd3Q8K2F0 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Brd3Q8K2F0 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Brd3Q8K2F0 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Brd3Q8K2F0 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Brd3Q8K2F0 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Brd3Q8K2F0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Brd3Q8K2F0 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Brd3Q8K2F0 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Brd3Q8K2F0 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Brd3Q8K2F0 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Brd3Q8K2F0 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Brd3Q8K2F0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Brd3Q8K2F0 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Brd3Q8K2F0 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Brd3Q8K2F0 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Brd3Q8K2F0 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Brd3Q8K2F0 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Brd3Q8K2F0 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Brd3Q8K2F0 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Brd3Q8K2F0 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Brd3Q8K2F0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Brd3Q8K2F0 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Brd3Q8K2F0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Brd3Q8K2F0 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Brd3Q8K2F0 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Brd3Q8K2F0 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Brd3Q8K2F0 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Brd3Q8K2F0 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Brd3Q8K2F0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Brd3Q8K2F0 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Brd3Q8K2F0 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Brd3Q8K2F0 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Brd3Q8K2F0 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Brd3Q8K2F0 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Brd3Q8K2F0 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Brd3Q8K2F0 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Brd3Q8K2F0 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Brd3Q8K2F0 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Brd3Q8K2F0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Brd3Q8K2F0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Brd3Q8K2F0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Brd3Q8K2F0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Brd3Q8K2F0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Brd3Q8K2F0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Brd3Q8K2F0 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Brd3Q8K2F0 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Brd3Q8K2F0 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Brd3Q8K2F0 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Brd3Q8K2F0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Brd3Q8K2F0 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Brd3Q8K2F0 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Brd3Q8K2F0 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Brd3Q8K2F0 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms