Protein–RNA interactions for Protein: Q8K284

Gtf3c1, General transcription factor 3C polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c1Q8K284 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf3c1Q8K284 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf3c1Q8K284 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf3c1Q8K284 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtf3c1Q8K284 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtf3c1Q8K284 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtf3c1Q8K284 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtf3c1Q8K284 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtf3c1Q8K284 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtf3c1Q8K284 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gtf3c1Q8K284 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gtf3c1Q8K284 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Gtf3c1Q8K284 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gtf3c1Q8K284 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gtf3c1Q8K284 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Gtf3c1Q8K284 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gtf3c1Q8K284 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gtf3c1Q8K284 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gtf3c1Q8K284 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gtf3c1Q8K284 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gtf3c1Q8K284 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf3c1Q8K284 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf3c1Q8K284 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf3c1Q8K284 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf3c1Q8K284 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf3c1Q8K284 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf3c1Q8K284 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf3c1Q8K284 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf3c1Q8K284 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf3c1Q8K284 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf3c1Q8K284 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf3c1Q8K284 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf3c1Q8K284 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf3c1Q8K284 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf3c1Q8K284 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf3c1Q8K284 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf3c1Q8K284 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf3c1Q8K284 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf3c1Q8K284 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf3c1Q8K284 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf3c1Q8K284 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf3c1Q8K284 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf3c1Q8K284 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf3c1Q8K284 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf3c1Q8K284 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf3c1Q8K284 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf3c1Q8K284 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf3c1Q8K284 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf3c1Q8K284 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf3c1Q8K284 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf3c1Q8K284 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf3c1Q8K284 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf3c1Q8K284 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf3c1Q8K284 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf3c1Q8K284 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf3c1Q8K284 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf3c1Q8K284 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf3c1Q8K284 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf3c1Q8K284 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf3c1Q8K284 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf3c1Q8K284 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf3c1Q8K284 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf3c1Q8K284 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf3c1Q8K284 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf3c1Q8K284 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf3c1Q8K284 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf3c1Q8K284 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf3c1Q8K284 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf3c1Q8K284 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf3c1Q8K284 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf3c1Q8K284 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf3c1Q8K284 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf3c1Q8K284 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf3c1Q8K284 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf3c1Q8K284 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf3c1Q8K284 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf3c1Q8K284 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf3c1Q8K284 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf3c1Q8K284 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf3c1Q8K284 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf3c1Q8K284 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf3c1Q8K284 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf3c1Q8K284 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf3c1Q8K284 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf3c1Q8K284 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf3c1Q8K284 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf3c1Q8K284 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf3c1Q8K284 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf3c1Q8K284 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf3c1Q8K284 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf3c1Q8K284 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf3c1Q8K284 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf3c1Q8K284 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf3c1Q8K284 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf3c1Q8K284 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf3c1Q8K284 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf3c1Q8K284 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf3c1Q8K284 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf3c1Q8K284 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf3c1Q8K284 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms