Protein–RNA interactions for Protein: Q8K136

Scnm1, Sodium channel modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scnm1Q8K136 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scnm1Q8K136 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Scnm1Q8K136 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scnm1Q8K136 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Scnm1Q8K136 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scnm1Q8K136 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scnm1Q8K136 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scnm1Q8K136 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scnm1Q8K136 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scnm1Q8K136 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scnm1Q8K136 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scnm1Q8K136 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scnm1Q8K136 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scnm1Q8K136 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scnm1Q8K136 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scnm1Q8K136 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scnm1Q8K136 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scnm1Q8K136 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scnm1Q8K136 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Scnm1Q8K136 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scnm1Q8K136 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scnm1Q8K136 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scnm1Q8K136 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scnm1Q8K136 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scnm1Q8K136 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scnm1Q8K136 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scnm1Q8K136 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scnm1Q8K136 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scnm1Q8K136 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scnm1Q8K136 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scnm1Q8K136 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scnm1Q8K136 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scnm1Q8K136 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scnm1Q8K136 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scnm1Q8K136 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scnm1Q8K136 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scnm1Q8K136 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scnm1Q8K136 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scnm1Q8K136 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scnm1Q8K136 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scnm1Q8K136 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scnm1Q8K136 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Scnm1Q8K136 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scnm1Q8K136 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scnm1Q8K136 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scnm1Q8K136 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scnm1Q8K136 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scnm1Q8K136 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scnm1Q8K136 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scnm1Q8K136 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Scnm1Q8K136 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Scnm1Q8K136 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scnm1Q8K136 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scnm1Q8K136 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scnm1Q8K136 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scnm1Q8K136 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scnm1Q8K136 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scnm1Q8K136 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scnm1Q8K136 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scnm1Q8K136 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scnm1Q8K136 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scnm1Q8K136 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scnm1Q8K136 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scnm1Q8K136 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scnm1Q8K136 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scnm1Q8K136 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scnm1Q8K136 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scnm1Q8K136 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Scnm1Q8K136 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scnm1Q8K136 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scnm1Q8K136 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scnm1Q8K136 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scnm1Q8K136 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scnm1Q8K136 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scnm1Q8K136 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scnm1Q8K136 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scnm1Q8K136 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scnm1Q8K136 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scnm1Q8K136 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scnm1Q8K136 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scnm1Q8K136 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scnm1Q8K136 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scnm1Q8K136 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scnm1Q8K136 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Scnm1Q8K136 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scnm1Q8K136 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scnm1Q8K136 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scnm1Q8K136 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scnm1Q8K136 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scnm1Q8K136 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scnm1Q8K136 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scnm1Q8K136 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scnm1Q8K136 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scnm1Q8K136 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scnm1Q8K136 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scnm1Q8K136 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scnm1Q8K136 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scnm1Q8K136 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scnm1Q8K136 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scnm1Q8K136 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms